CAJ | 학술논문

根据对中国野生葡萄华东葡萄株系白河-35-1在白粉病诱导下构建的cDNA文库中获得的1条EST序列设计特异引物,以总RNA逆转录产物为模板,进行SMART-RACE扩增.结合生物信息学方法对所获的序列进行开放阅读框、序列同源性分析,并预测了蛋白质的理化性质、信号肽、酶与非酶分析、亚细胞定位以及蛋白质二级结构.结果表明,获得的中国野生葡萄新基因的全长序列为854 bp,其开放阅读框为585 bp,5'非编码区为107 bp,3'非编码区为162 bp;同源性比对表明该新基因推导的氨基酸序列与拟南芥RNA结合蛋白和水稻推定的半乳糖基转移酶的同源性分别为55%和63%,第8～82位氨基酸序列与RNA识别基序相类似,是一个典型的结构功能域;推导该基因表达产物为相对分子质量为21 801.27、等电点为6.86的不稳定蛋白,定位于细胞核,不包含信号肽,二级结构主要是无规则卷曲.
근거대중국야생포도화동포도주계백하-35-1재백분병유도하구건적cDNA문고중획득적1조EST서렬설계특이인물,이총RNA역전록산물위모판,진행SMART-RACE확증.결합생물신식학방법대소획적서렬진행개방열독광、서렬동원성분석,병예측료단백질적이화성질、신호태、매여비매분석、아세포정위이급단백질이급결구.결과표명,획득적중국야생포도신기인적전장서렬위854 bp,기개방열독광위585 bp,5'비편마구위107 bp,3'비편마구위162 bp;동원성비대표명해신기인추도적안기산서렬여의남개RNA결합단백화수도추정적반유당기전이매적동원성분별위55%화63%,제8～82위안기산서렬여RNA식별기서상유사,시일개전형적결구공능역;추도해기인표체산물위상대분자질량위21 801.27、등전점위6.86적불은정단백,정위우세포핵,불포함신호태,이급결구주요시무규칙권곡.