中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2012年
5期
413-417
,共5页
李鹏%宋楠楠%岳盈盈%李志会%张颖%盖中涛%孟红
李鵬%宋楠楠%嶽盈盈%李誌會%張穎%蓋中濤%孟紅
리붕%송남남%악영영%리지회%장영%개중도%맹홍
EV71%毒力%全基因组%序列分析
EV71%毒力%全基因組%序列分析
EV71%독력%전기인조%서렬분석
目的 了解济南市2008年EV71的流行和变异情况,寻求潜在的EV71毒力决定位点.方法 采用分段扩增的RT-PCR方法 对EV71 JN200803和JN200804株的基因组全长进行扩增、测序.对两株EV71的全基因组核苷酸、氨基酸序列进行比较,对非编码区进行RNA二级结构的预测和分析,并对VP1区和全基因组进行遗传进化分析.结果 EV71 JN200803和JN200804株的基因组全长分别为7 405 nt和7 404 nt,编码区没有核苷酸的插入和缺失,全基因组序列的组成和结构均符合肠道病毒71型的特征.JN200803和JN200804全基因组有106个核苷酸突变,编码区98个,非编码区8个,编码区多数属于同义突变,仅造成16个氨基酸突变.遗传进化分析显示,EV71 JN200803和JN200804株与2008年国内其他流行株同属C4亚型的C4a进化分支,与Fuyang/17.08/1株进化关系最近.结论 2008年济南市流行的EV71属于C4a亚型,济南分离株的毒力决定位点不但具有非单一性,而且具有较为独特的济南区域特点.
目的 瞭解濟南市2008年EV71的流行和變異情況,尋求潛在的EV71毒力決定位點.方法 採用分段擴增的RT-PCR方法 對EV71 JN200803和JN200804株的基因組全長進行擴增、測序.對兩株EV71的全基因組覈苷痠、氨基痠序列進行比較,對非編碼區進行RNA二級結構的預測和分析,併對VP1區和全基因組進行遺傳進化分析.結果 EV71 JN200803和JN200804株的基因組全長分彆為7 405 nt和7 404 nt,編碼區沒有覈苷痠的插入和缺失,全基因組序列的組成和結構均符閤腸道病毒71型的特徵.JN200803和JN200804全基因組有106箇覈苷痠突變,編碼區98箇,非編碼區8箇,編碼區多數屬于同義突變,僅造成16箇氨基痠突變.遺傳進化分析顯示,EV71 JN200803和JN200804株與2008年國內其他流行株同屬C4亞型的C4a進化分支,與Fuyang/17.08/1株進化關繫最近.結論 2008年濟南市流行的EV71屬于C4a亞型,濟南分離株的毒力決定位點不但具有非單一性,而且具有較為獨特的濟南區域特點.
목적 료해제남시2008년EV71적류행화변이정황,심구잠재적EV71독력결정위점.방법 채용분단확증적RT-PCR방법 대EV71 JN200803화JN200804주적기인조전장진행확증、측서.대량주EV71적전기인조핵감산、안기산서렬진행비교,대비편마구진행RNA이급결구적예측화분석,병대VP1구화전기인조진행유전진화분석.결과 EV71 JN200803화JN200804주적기인조전장분별위7 405 nt화7 404 nt,편마구몰유핵감산적삽입화결실,전기인조서렬적조성화결구균부합장도병독71형적특정.JN200803화JN200804전기인조유106개핵감산돌변,편마구98개,비편마구8개,편마구다수속우동의돌변,부조성16개안기산돌변.유전진화분석현시,EV71 JN200803화JN200804주여2008년국내기타류행주동속C4아형적C4a진화분지,여Fuyang/17.08/1주진화관계최근.결론 2008년제남시류행적EV71속우C4a아형,제남분리주적독력결정위점불단구유비단일성,이차구유교위독특적제남구역특점.
