江苏大学学报（医学版）
江囌大學學報（醫學版）
강소대학학보（의학판）
JOURNAL OF JIANGSU UNIVERSITY (MEDICINE EDITION)
2011年
1期
18-22
,共5页
张伟%胡玉静%金珊珊%杨海伟%魏继福%何韶衡
張偉%鬍玉靜%金珊珊%楊海偉%魏繼福%何韶衡
장위%호옥정%금산산%양해위%위계복%하소형
德国小蠊%谷胱甘肽转移酶%抗原表位%三维结构建模
德國小蠊%穀胱甘肽轉移酶%抗原錶位%三維結構建模
덕국소렴%곡광감태전이매%항원표위%삼유결구건모
目的:通过生物信息学方法了解德国小蠊变应原BgGSTD1的结构特征,为蟑螂变态反应性疾病的诊断和治疗提供线索.方法:在NCBI数据库中获得BgGSTD1蛋白序列,Blast得到其相似序列,并应用Clustalx 1.83构建同源进化树,联合应用DNA Star多种方法预测其抗原表位,在Scan Prosite数据库中进行Motif预测,并应用SWISS- MODEL服务器进行自动建模,得到其三维结构.结果:德国小蠊BgGSTD1与美洲大蠊谷胱甘肽转移酶在进化上具有较近的亲缘关系.BgGSTD1主要为α+β结构的混合蛋白,其主要抗原表位集中于9-10,58-61,79-81,86-87,179-180,189-190,216.Motif预测其具有一个谷胱甘肽转移酶N-末端区和谷胱甘肽转移酶C-末端区.Swiss-Model服务器预测的三维结构基本能反应BgGSTD1真实的空间构象.结论:通过BgGSTD1的生物信息学分析获得了该变应原分子特征及三维结构模型,为进一步了解和掌握BgGSTD1的结构功能打下理论基础.
目的:通過生物信息學方法瞭解德國小蠊變應原BgGSTD1的結構特徵,為蟑螂變態反應性疾病的診斷和治療提供線索.方法:在NCBI數據庫中穫得BgGSTD1蛋白序列,Blast得到其相似序列,併應用Clustalx 1.83構建同源進化樹,聯閤應用DNA Star多種方法預測其抗原錶位,在Scan Prosite數據庫中進行Motif預測,併應用SWISS- MODEL服務器進行自動建模,得到其三維結構.結果:德國小蠊BgGSTD1與美洲大蠊穀胱甘肽轉移酶在進化上具有較近的親緣關繫.BgGSTD1主要為α+β結構的混閤蛋白,其主要抗原錶位集中于9-10,58-61,79-81,86-87,179-180,189-190,216.Motif預測其具有一箇穀胱甘肽轉移酶N-末耑區和穀胱甘肽轉移酶C-末耑區.Swiss-Model服務器預測的三維結構基本能反應BgGSTD1真實的空間構象.結論:通過BgGSTD1的生物信息學分析穫得瞭該變應原分子特徵及三維結構模型,為進一步瞭解和掌握BgGSTD1的結構功能打下理論基礎.
목적:통과생물신식학방법료해덕국소렴변응원BgGSTD1적결구특정,위장랑변태반응성질병적진단화치료제공선색.방법:재NCBI수거고중획득BgGSTD1단백서렬,Blast득도기상사서렬,병응용Clustalx 1.83구건동원진화수,연합응용DNA Star다충방법예측기항원표위,재Scan Prosite수거고중진행Motif예측,병응용SWISS- MODEL복무기진행자동건모,득도기삼유결구.결과:덕국소렴BgGSTD1여미주대렴곡광감태전이매재진화상구유교근적친연관계.BgGSTD1주요위α+β결구적혼합단백,기주요항원표위집중우9-10,58-61,79-81,86-87,179-180,189-190,216.Motif예측기구유일개곡광감태전이매N-말단구화곡광감태전이매C-말단구.Swiss-Model복무기예측적삼유결구기본능반응BgGSTD1진실적공간구상.결론:통과BgGSTD1적생물신식학분석획득료해변응원분자특정급삼유결구모형,위진일보료해화장악BgGSTD1적결구공능타하이론기출.
