生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2009年
6期
668-675
,共8页
李宁%吴松锋%朱云平%杨晓明
李寧%吳鬆鋒%硃雲平%楊曉明
리저%오송봉%주운평%양효명
串联质谱%蛋白质鉴定%蛋白质纽装%蛋白质鉴定置信度%鸟枪法
串聯質譜%蛋白質鑒定%蛋白質紐裝%蛋白質鑒定置信度%鳥鎗法
천련질보%단백질감정%단백질뉴장%단백질감정치신도%조창법
鸟枪法串联质谱蛋白质鉴定策略由于其高可靠和高效率而被广泛应用于蛋白质组学研究中,这种方法直接对蛋白质混合物进行酶切,以肽段为鉴定单元,继而推导真实的样品蛋白质.由于利用质谱图推导肽段存在一定的假阳性率,而且直接对蛋白质混合物的酶切也导致了肽段和蛋白质之间关联信息的丢失,所鉴定的蛋白质难免存在部分不可靠结果.因此,蛋白质鉴定的质量控制在蛋白质组学研究中极为重要.蛋白质鉴定的质量控制包含两大类主要方法,其一为利用肽段进行蛋白质组装,当前最常用也被证明最有效的方法是使用简约原则,即用最少的蛋白质解释所有鉴定肽段,现有的方法可以分为布尔型和概率犁,其二为鉴定蛋白质的可靠性评估,包括单个蛋白质鉴定置信度和蛋白质鉴定整体水平的假阳性率计算.综合各种可辅助蛋白质鉴定的先验信息,构建普适的概率统计模型,是日前蛋白质鉴定质鼍控制方法的发展趋势.
鳥鎗法串聯質譜蛋白質鑒定策略由于其高可靠和高效率而被廣汎應用于蛋白質組學研究中,這種方法直接對蛋白質混閤物進行酶切,以肽段為鑒定單元,繼而推導真實的樣品蛋白質.由于利用質譜圖推導肽段存在一定的假暘性率,而且直接對蛋白質混閤物的酶切也導緻瞭肽段和蛋白質之間關聯信息的丟失,所鑒定的蛋白質難免存在部分不可靠結果.因此,蛋白質鑒定的質量控製在蛋白質組學研究中極為重要.蛋白質鑒定的質量控製包含兩大類主要方法,其一為利用肽段進行蛋白質組裝,噹前最常用也被證明最有效的方法是使用簡約原則,即用最少的蛋白質解釋所有鑒定肽段,現有的方法可以分為佈爾型和概率犛,其二為鑒定蛋白質的可靠性評估,包括單箇蛋白質鑒定置信度和蛋白質鑒定整體水平的假暘性率計算.綜閤各種可輔助蛋白質鑒定的先驗信息,構建普適的概率統計模型,是日前蛋白質鑒定質鼉控製方法的髮展趨勢.
조창법천련질보단백질감정책략유우기고가고화고효솔이피엄범응용우단백질조학연구중,저충방법직접대단백질혼합물진행매절,이태단위감정단원,계이추도진실적양품단백질.유우이용질보도추도태단존재일정적가양성솔,이차직접대단백질혼합물적매절야도치료태단화단백질지간관련신식적주실,소감정적단백질난면존재부분불가고결과.인차,단백질감정적질량공제재단백질조학연구중겁위중요.단백질감정적질량공제포함량대류주요방법,기일위이용태단진행단백질조장,당전최상용야피증명최유효적방법시사용간약원칙,즉용최소적단백질해석소유감정태단,현유적방법가이분위포이형화개솔리,기이위감정단백질적가고성평고,포괄단개단백질감정치신도화단백질감정정체수평적가양성솔계산.종합각충가보조단백질감정적선험신식,구건보괄적개솔통계모형,시일전단백질감정질타공제방법적발전추세.
