CAJ | 학술논문

本研究探讨白血病t(8;21)染色体易位形成的融合癌蛋白AML1-ETO在2、9、19号3条染色体上基因组水平的结合位点分布,从而探索其在白血病发生发展过程中异常的转录调控模式,为靶向治疗药物研发以及临床治疗方案优化提供理论基础.应用染色质免疫沉淀技术与高通量的基因芯片相结合的ChIP-on-chip技术,使用覆盖上述3条染色体上所有基因组信息的瓦式基因芯片,在具有t(8;21)染色体易位的Kasumi细胞株上展开研究.实验分为抗ETO特异抗体组和随机打断基因组DNA对照组.通过MAT方法分析ETO抗体组相对于对照组的富集片段;应用CEAS分析工具分析富集片段在基因组上的分布特征,并进一步通过功能富集分析方法挖掘其中潜藏的生物学意义.结果表明:ETO抗体组在2、9、19号染色体上共得到富集片段588条,这些片段在基因组的定位分布特征如下:5.96%位于基因启动子区域,5.49%位于基因外显子区域,48.86%位于增强子区域,37.35%位于基因内含子区域,1.27%位于即时下游区域,0.87%位于3'UTR,0.2%位于5'UTR.进一步功能富集分析结果显示:参与代谢调节、细胞增殖、信号传导等功能的模块在AML1-ETO的潜在靶基因中富集.结论:AML1-ETO融合蛋白在基因组上的结合位点过半分布在经典转录因子结合区域(启动子、5JTR和增强子),其余近半分布在非经典的区域,其下游调控的分子网络广泛涉及多种重要功能通路.
본연구탐토백혈병t(8;21)염색체역위형성적융합암단백AML1-ETO재2、9、19호3조염색체상기인조수평적결합위점분포,종이탐색기재백혈병발생발전과정중이상적전록조공모식,위파향치료약물연발이급림상치료방안우화제공이론기출.응용염색질면역침정기술여고통량적기인심편상결합적ChIP-on-chip기술,사용복개상술3조염색체상소유기인조신식적와식기인심편,재구유t(8;21)염색체역위적Kasumi세포주상전개연구.실험분위항ETO특이항체조화수궤타단기인조DNA대조조.통과MAT방법분석ETO항체조상대우대조조적부집편단;응용CEAS분석공구분석부집편단재기인조상적분포특정,병진일보통과공능부집분석방법알굴기중잠장적생물학의의.결과표명:ETO항체조재2、9、19호염색체상공득도부집편단588조,저사편단재기인조적정위분포특정여하:5.96%위우기인계동자구역,5.49%위우기인외현자구역,48.86%위우증강자구역,37.35%위우기인내함자구역,1.27%위우즉시하유구역,0.87%위우3'UTR,0.2%위우5'UTR.진일보공능부집분석결과현시:삼여대사조절、세포증식、신호전도등공능적모괴재AML1-ETO적잠재파기인중부집.결론:AML1-ETO융합단백재기인조상적결합위점과반분포재경전전록인자결합구역(계동자、5JTR화증강자),기여근반분포재비경전적구역,기하유조공적분자망락엄범섭급다충중요공능통로.