海洋学报(中文版)
海洋學報(中文版)
해양학보(중문판)
ACTA OCEANOLOGICA SINICA
2011年
1期
163-169
,共7页
刘晨临%陈艳%刘胜浩%黄晓航
劉晨臨%陳豔%劉勝浩%黃曉航
류신림%진염%류성호%황효항
"塔玛复合种"%SSU rDNA%ITS%条形码
"塔瑪複閤種"%SSU rDNA%ITS%條形碼
"탑마복합충"%SSU rDNA%ITS%조형마
利用SSu rDNA和ITS分子指标,结合GenBank和其他文献中的基因序列构建了系统树,对一株分离自我国南海的亚历山大藻"塔玛复合种"NH01进行了鉴定,发现SSU rDNA和ITS序列构建的系统树中,不同地理基因型的"塔玛复合种"均构成独立分支.与我国沿海所有的"塔玛复合种"一致,NH01也属于"亚洲温带"型.探讨了SSU rDNA和ITS分子指标用于塔玛和链状亚历山大藻鉴别的可行性,比较了2种不同的基于ITS序列的亚历山大藻的系统分类方法.认为SSU rDNA和ITS序列均可以应用于亚历山大藻种甚至种下水平的检测,可以准确判断其地理基因型.提出利用SSU rDNA和ITS等核酸序列标记的方法作为鉴定、调研我国海域的亚历山大藻"塔玛复合种"的常规手段.通过比对不同地理基因型的ITS序列,确定了一段DNA序列,可以用于鉴别不同地理基因型的亚历山大藻"塔玛复合种".
利用SSu rDNA和ITS分子指標,結閤GenBank和其他文獻中的基因序列構建瞭繫統樹,對一株分離自我國南海的亞歷山大藻"塔瑪複閤種"NH01進行瞭鑒定,髮現SSU rDNA和ITS序列構建的繫統樹中,不同地理基因型的"塔瑪複閤種"均構成獨立分支.與我國沿海所有的"塔瑪複閤種"一緻,NH01也屬于"亞洲溫帶"型.探討瞭SSU rDNA和ITS分子指標用于塔瑪和鏈狀亞歷山大藻鑒彆的可行性,比較瞭2種不同的基于ITS序列的亞歷山大藻的繫統分類方法.認為SSU rDNA和ITS序列均可以應用于亞歷山大藻種甚至種下水平的檢測,可以準確判斷其地理基因型.提齣利用SSU rDNA和ITS等覈痠序列標記的方法作為鑒定、調研我國海域的亞歷山大藻"塔瑪複閤種"的常規手段.通過比對不同地理基因型的ITS序列,確定瞭一段DNA序列,可以用于鑒彆不同地理基因型的亞歷山大藻"塔瑪複閤種".
이용SSu rDNA화ITS분자지표,결합GenBank화기타문헌중적기인서렬구건료계통수,대일주분리자아국남해적아력산대조"탑마복합충"NH01진행료감정,발현SSU rDNA화ITS서렬구건적계통수중,불동지리기인형적"탑마복합충"균구성독립분지.여아국연해소유적"탑마복합충"일치,NH01야속우"아주온대"형.탐토료SSU rDNA화ITS분자지표용우탑마화련상아력산대조감별적가행성,비교료2충불동적기우ITS서렬적아력산대조적계통분류방법.인위SSU rDNA화ITS서렬균가이응용우아력산대조충심지충하수평적검측,가이준학판단기지리기인형.제출이용SSU rDNA화ITS등핵산서렬표기적방법작위감정、조연아국해역적아력산대조"탑마복합충"적상규수단.통과비대불동지리기인형적ITS서렬,학정료일단DNA서렬,가이용우감별불동지리기인형적아력산대조"탑마복합충".