生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2010年
2期
118-123
,共6页
拟南芥%水稻%杨树%JMJC基因家族
擬南芥%水稻%楊樹%JMJC基因傢族
의남개%수도%양수%JMJC기인가족
采用HMMER与BLAST相结合的方法确定拟南芥,水稻和杨树三种模式植物全基因组JMJC蛋白基因个数分别为21,20,24,并对其染色体定位,基因结构,保守功能域进行了系统分析,在系统进化分析基础上,将JMJC家族分为11 个亚家族,内含子外显子结构分析与MPSS表达模式分析结果也进一步支持了进化关系研究.本研究有助于揭示植物JMJC基因家族的进化历史,为后续JMJ基因家族的功能提供线索,为进一步研究植物JMJC基因家族提供理论基础.
採用HMMER與BLAST相結閤的方法確定擬南芥,水稻和楊樹三種模式植物全基因組JMJC蛋白基因箇數分彆為21,20,24,併對其染色體定位,基因結構,保守功能域進行瞭繫統分析,在繫統進化分析基礎上,將JMJC傢族分為11 箇亞傢族,內含子外顯子結構分析與MPSS錶達模式分析結果也進一步支持瞭進化關繫研究.本研究有助于揭示植物JMJC基因傢族的進化歷史,為後續JMJ基因傢族的功能提供線索,為進一步研究植物JMJC基因傢族提供理論基礎.
채용HMMER여BLAST상결합적방법학정의남개,수도화양수삼충모식식물전기인조JMJC단백기인개수분별위21,20,24,병대기염색체정위,기인결구,보수공능역진행료계통분석,재계통진화분석기출상,장JMJC가족분위11 개아가족,내함자외현자결구분석여MPSS표체모식분석결과야진일보지지료진화관계연구.본연구유조우게시식물JMJC기인가족적진화역사,위후속JMJ기인가족적공능제공선색,위진일보연구식물JMJC기인가족제공이론기출.