两株刚果红结合突变型志贺菌大质粒全基因组比较研究
량주강과홍결합돌변형지하균대질립전기인조비교연구
  • 万方数据
    中国科学C辑 중국과학C집
    SCIENCE IN CHINA (SERIES C)
    2005年 5期 416-423 ,共8页

    唐旭东%熊朝晖%杨帆%张笑冰%杨剑%陈立宏%聂桓%燕永亮%江艳%王璟%薛颖%徐星烨%朱亚芳%董杰%安黎哲%王勋陵%金奇

    당욱동%웅조휘%양범%장소빙%양검%진립굉%섭환%연영량%강염%왕경%설영%서성엽%주아방%동걸%안려철%왕훈릉%금기

    福氏志贺菌5型%志贺氏志贺菌1型%大质粒%pSF5%pSD1%刚果红%基因组比较 福氏誌賀菌5型%誌賀氏誌賀菌1型%大質粒%pSF5%pSD1%剛果紅%基因組比較
    복씨지하균5형%지하씨지하균1형%대질립%pSF5%pSD1%강과홍%기인조비교
    对福氏志贺菌(Shigella flexneri)5型及志贺氏志贺菌(Shigella dysenteriae)1型两株与刚果红结合突变菌株的大质粒pSF5及pSD1进行了全基因组测序及分析. pSF5全长136694 bp, 包含165个ORFs, 其中133个功能明确, 32个功能未知. pSD1全长182726 bp, 共有224个ORFs, 其中181个功能明确, 43个功能未知. pSF5中IS序列为53787 bp, pSD1中为49616 bp, 分别占整个基因组的39.3%, 27.2%. 二者中共有22种不同类型的IS出现, 其中ISEc8, ISSbo6在志贺菌大质粒中为首次报道. 与pCP301相比, pSF5和pSD1都发生了大范围基因缺失, 并在多处发生基因片段倒置等现象. pSF5中除与侵袭相关ipa-mxi-spa基因岛完全缺失外, 与O-抗原生物合成密切相关的shf-rfbU-msbB基因也部分缺失, 而在pSD1中上述基因则完整存在, 但pSD1中与侵袭基因表达调控相关的virF基因缺失. 结果表明, 在pSF5和pSD1中与侵袭相关的调控因子及侵袭基因的缺失是导致刚果红结合突变的原因之一, 但是否是唯一的原因还需进一步的验证.
    대복씨지하균(Shigella flexneri)5형급지하씨지하균(Shigella dysenteriae)1형량주여강과홍결합돌변균주적대질립pSF5급pSD1진행료전기인조측서급분석. pSF5전장136694 bp, 포함165개ORFs, 기중133개공능명학, 32개공능미지. pSD1전장182726 bp, 공유224개ORFs, 기중181개공능명학, 43개공능미지. pSF5중IS서렬위53787 bp, pSD1중위49616 bp, 분별점정개기인조적39.3%, 27.2%. 이자중공유22충불동류형적IS출현, 기중ISEc8, ISSbo6재지하균대질립중위수차보도. 여pCP301상비, pSF5화pSD1도발생료대범위기인결실, 병재다처발생기인편단도치등현상. pSF5중제여침습상관ipa-mxi-spa기인도완전결실외, 여O-항원생물합성밀절상관적shf-rfbU-msbB기인야부분결실, 이재pSD1중상술기인칙완정존재, 단pSD1중여침습기인표체조공상관적virF기인결실. 결과표명, 재pSF5화pSD1중여침습상관적조공인자급침습기인적결실시도치강과홍결합돌변적원인지일, 단시부시유일적원인환수진일보적험증.
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