生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2009年
1期
5-8
,共4页
卢学春%楼方定%韩为东%于力
盧學春%樓方定%韓為東%于力
로학춘%루방정%한위동%우력
LRP16基因%启动子%视黄醇受体%雌激素受体%IL-6受体
LRP16基因%啟動子%視黃醇受體%雌激素受體%IL-6受體
LRP16기인%계동자%시황순수체%자격소수체%IL-6수체
为分析LRP16基因启动子区顺式调控元件,为深入研究LRP16基因的表达调控机制奠定基础.首先在NCBI的人类基因组数据库中截取并下载LRP16基因转录起始位点5'侧翼区2.6kb的基因组序列,设计PCR引物,从健康外周血单个核细胞中扩增LRP16基因的启动子分子;然后构建包含长度为2.6kb的LRP16基因启动子分子的pGL3-LRP16启动子荧光素酶报道重组子,转染入Hela细胞后检测荧光素酶活性;最后利用Genomatix MatInspector Release professional 5.3、RSA-tools和TESS 3个启动子顺式调控元件数据库对LRP16基因启动子进行分析.结果表明LRP16基因启动子DNA序列具有真核启动子活性,该区域既有通用启动子结构,又具有与肿瘤发生、细胞周期调控和急性反应期蛋白有关的顺式调控元件,包括:Sp1、T-Ag、ZF5、CAC盒、PU.1、c-Ets、XPF-1、IL-6受体、雌激素受体和视黄醇受体.
為分析LRP16基因啟動子區順式調控元件,為深入研究LRP16基因的錶達調控機製奠定基礎.首先在NCBI的人類基因組數據庫中截取併下載LRP16基因轉錄起始位點5'側翼區2.6kb的基因組序列,設計PCR引物,從健康外週血單箇覈細胞中擴增LRP16基因的啟動子分子;然後構建包含長度為2.6kb的LRP16基因啟動子分子的pGL3-LRP16啟動子熒光素酶報道重組子,轉染入Hela細胞後檢測熒光素酶活性;最後利用Genomatix MatInspector Release professional 5.3、RSA-tools和TESS 3箇啟動子順式調控元件數據庫對LRP16基因啟動子進行分析.結果錶明LRP16基因啟動子DNA序列具有真覈啟動子活性,該區域既有通用啟動子結構,又具有與腫瘤髮生、細胞週期調控和急性反應期蛋白有關的順式調控元件,包括:Sp1、T-Ag、ZF5、CAC盒、PU.1、c-Ets、XPF-1、IL-6受體、雌激素受體和視黃醇受體.
위분석LRP16기인계동자구순식조공원건,위심입연구LRP16기인적표체조공궤제전정기출.수선재NCBI적인류기인조수거고중절취병하재LRP16기인전록기시위점5'측익구2.6kb적기인조서렬,설계PCR인물,종건강외주혈단개핵세포중확증LRP16기인적계동자분자;연후구건포함장도위2.6kb적LRP16기인계동자분자적pGL3-LRP16계동자형광소매보도중조자,전염입Hela세포후검측형광소매활성;최후이용Genomatix MatInspector Release professional 5.3、RSA-tools화TESS 3개계동자순식조공원건수거고대LRP16기인계동자진행분석.결과표명LRP16기인계동자DNA서렬구유진핵계동자활성,해구역기유통용계동자결구,우구유여종류발생、세포주기조공화급성반응기단백유관적순식조공원건,포괄:Sp1、T-Ag、ZF5、CAC합、PU.1、c-Ets、XPF-1、IL-6수체、자격소수체화시황순수체.
