病毒学报
病毒學報
병독학보
CHINESE JOURNAL OF VIROLOGY
2007年
4期
270-275
,共6页
翟友刚%王焕琴%付士红%梁国栋
翟友剛%王煥琴%付士紅%樑國棟
적우강%왕환금%부사홍%량국동
盖塔病毒%衣壳蛋白基因%3'非翻译区%核苷酸序列%系统发生树
蓋塔病毒%衣殼蛋白基因%3'非翻譯區%覈苷痠序列%繫統髮生樹
개탑병독%의각단백기인%3'비번역구%핵감산서렬%계통발생수
对我国海南省和河北省分离到的3株盖塔病毒(GETV)(M1、HB0215-3和HB0234)进行衣壳蛋白基因和3'UTR区序列测定,并分析比较该病毒的分子生物学遗传特征.首先应用逆转录聚合酶链反应扩增出病毒衣壳蛋白基因和3'UTR片段,纯化后连接到载体中进行测序,然后用Clastal X和DNASTAR软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,用MEGA软件绘制系统发生树.3株病毒衣壳蛋白基因分别由801、804和804个核苷酸组成,分别编码267、268和268个氨基酸,3株病毒之间核苷酸和氨基酸序列同源性为97.6%～100%和97.8%～100%,与其他GETV分离株核苷酸同源性在95.4%～99.6%之间.3株病毒3'UTR分别由411、401和401个核苷酸组成,发现中国株存在10个(45～54位)核苷酸缺失和2个(64位、148位)特有的核苷酸位点.进化分析表明盖塔病毒之间的进化关系与分离年代相关,中国境内流行的盖塔病毒是相对独立的一个类群.
對我國海南省和河北省分離到的3株蓋塔病毒(GETV)(M1、HB0215-3和HB0234)進行衣殼蛋白基因和3'UTR區序列測定,併分析比較該病毒的分子生物學遺傳特徵.首先應用逆轉錄聚閤酶鏈反應擴增齣病毒衣殼蛋白基因和3'UTR片段,純化後連接到載體中進行測序,然後用Clastal X和DNASTAR軟件對測定的覈苷痠和推測的氨基痠序列進行比較分析,用MEGA軟件繪製繫統髮生樹.3株病毒衣殼蛋白基因分彆由801、804和804箇覈苷痠組成,分彆編碼267、268和268箇氨基痠,3株病毒之間覈苷痠和氨基痠序列同源性為97.6%～100%和97.8%～100%,與其他GETV分離株覈苷痠同源性在95.4%～99.6%之間.3株病毒3'UTR分彆由411、401和401箇覈苷痠組成,髮現中國株存在10箇(45～54位)覈苷痠缺失和2箇(64位、148位)特有的覈苷痠位點.進化分析錶明蓋塔病毒之間的進化關繫與分離年代相關,中國境內流行的蓋塔病毒是相對獨立的一箇類群.
대아국해남성화하북성분리도적3주개탑병독(GETV)(M1、HB0215-3화HB0234)진행의각단백기인화3'UTR구서렬측정,병분석비교해병독적분자생물학유전특정.수선응용역전록취합매련반응확증출병독의각단백기인화3'UTR편단,순화후련접도재체중진행측서,연후용Clastal X화DNASTAR연건대측정적핵감산화추측적안기산서렬진행비교분석,용MEGA연건회제계통발생수.3주병독의각단백기인분별유801、804화804개핵감산조성,분별편마267、268화268개안기산,3주병독지간핵감산화안기산서렬동원성위97.6%～100%화97.8%～100%,여기타GETV분리주핵감산동원성재95.4%～99.6%지간.3주병독3'UTR분별유411、401화401개핵감산조성,발현중국주존재10개(45～54위)핵감산결실화2개(64위、148위)특유적핵감산위점.진화분석표명개탑병독지간적진화관계여분리년대상관,중국경내류행적개탑병독시상대독립적일개류군.
