遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2008年
7期
885-892
,共8页
李明%赵巧辉%陈其新%刘孟洲%石晓卫
李明%趙巧輝%陳其新%劉孟洲%石曉衛
리명%조교휘%진기신%류맹주%석효위
家兔%BMP7%3′非翻译序列%克隆%3′RACE%生物信息学分析
傢兔%BMP7%3′非翻譯序列%剋隆%3′RACE%生物信息學分析
가토%BMP7%3′비번역서렬%극륭%3′RACE%생물신식학분석
在对已知部分编码序列(CDS)进行分析的基础上,采用RT-PCR分步扩增以及RACE方法,对家兔BMP7基因3′和5′末端未知序列进行了克隆与生物信息学分析.测序结果综合分析表明,所获序列共计1 654 bp,包括家兔BMP7近全长前肽、全长成熟肽CDS及3′非翻译序列(3′UTR),将已有的序列向5′和3′端分别延伸了395bp和628 bp.序列对比表明,克隆的家兔BMP7 CDS部分与人、小鼠的对应序列的同源性分别为91.89%和89.32%,预测的氨基酸序列同源性分别为96.51%和96.01%.家兔BMP7 3′UTR长446 bp,与人,小鼠对应序列同源性分别为57.38%和45.57%;具有2个转录终止信号位点.推测家兔BMP7成熟蛋白有BMPs特有的7个位置固定的半胱氨酸残基和TGF-β家族指纹.家兔BMP7 3′UTR区转录终止信号的可选择性可能与基因转录后调控有关.
在對已知部分編碼序列(CDS)進行分析的基礎上,採用RT-PCR分步擴增以及RACE方法,對傢兔BMP7基因3′和5′末耑未知序列進行瞭剋隆與生物信息學分析.測序結果綜閤分析錶明,所穫序列共計1 654 bp,包括傢兔BMP7近全長前肽、全長成熟肽CDS及3′非翻譯序列(3′UTR),將已有的序列嚮5′和3′耑分彆延伸瞭395bp和628 bp.序列對比錶明,剋隆的傢兔BMP7 CDS部分與人、小鼠的對應序列的同源性分彆為91.89%和89.32%,預測的氨基痠序列同源性分彆為96.51%和96.01%.傢兔BMP7 3′UTR長446 bp,與人,小鼠對應序列同源性分彆為57.38%和45.57%;具有2箇轉錄終止信號位點.推測傢兔BMP7成熟蛋白有BMPs特有的7箇位置固定的半胱氨痠殘基和TGF-β傢族指紋.傢兔BMP7 3′UTR區轉錄終止信號的可選擇性可能與基因轉錄後調控有關.
재대이지부분편마서렬(CDS)진행분석적기출상,채용RT-PCR분보확증이급RACE방법,대가토BMP7기인3′화5′말단미지서렬진행료극륭여생물신식학분석.측서결과종합분석표명,소획서렬공계1 654 bp,포괄가토BMP7근전장전태、전장성숙태CDS급3′비번역서렬(3′UTR),장이유적서렬향5′화3′단분별연신료395bp화628 bp.서렬대비표명,극륭적가토BMP7 CDS부분여인、소서적대응서렬적동원성분별위91.89%화89.32%,예측적안기산서렬동원성분별위96.51%화96.01%.가토BMP7 3′UTR장446 bp,여인,소서대응서렬동원성분별위57.38%화45.57%;구유2개전록종지신호위점.추측가토BMP7성숙단백유BMPs특유적7개위치고정적반광안산잔기화TGF-β가족지문.가토BMP7 3′UTR구전록종지신호적가선택성가능여기인전록후조공유관.