热带海洋学报
熱帶海洋學報
열대해양학보
JOURNAL OF TROPICAL OCEANOGRAPHY
2010年
5期
125-131
,共7页
胡永乐%梁旭方%王琳%李观贵%刘秀霞%王云新%张海发
鬍永樂%樑旭方%王琳%李觀貴%劉秀霞%王雲新%張海髮
호영악%량욱방%왕림%리관귀%류수하%왕운신%장해발
胰蛋白酶原%淀粉酶%基因克隆%序列分析%斜带石斑鱼Epinephelus coioides
胰蛋白酶原%澱粉酶%基因剋隆%序列分析%斜帶石斑魚Epinephelus coioides
이단백매원%정분매%기인극륭%서렬분석%사대석반어Epinephelus coioides
采用RT-PCR及RACE法从斜带石斑鱼Epinephelus coioides肝胰脏克隆得到胰蛋白酶原(trypsinogen,TRY)与淀粉酶(amylase,AMY)基因cDNA全序列.斜带石斑鱼肝胰脏TRY基因cDNA全长911 bp,其中5非翻译区(5'-UTR)为55bp,3'-UTR为127bp,开放阅读框(ORF)为729bp,编码242个氨基酸,包含所有丝氨酸蛋白酶中共有的高度保守的催化活性中心.序列一致性分析发现,斜带石斑鱼与牙鲆Paralichthys olivaceus、金头鲷Sparus aurata、鳎Solea senegalensis、石鲽Pleuronectes bicoloratus的TRY序列相似性高达86.8%-89.70%,与人Homo sapiens小鼠Mus musculus、斑马鱼Danio rerio的TRY相似性较低为59.9%-64.5%.斜带石斑鱼AMY基因cDNA全长1657bp,其中5'-UTR为41bp,3'-UTR为77 bp,ORF为1539bp,编码512个氨基酸,包含与哺乳动物α-AMY二级结构相似的8个α旋和8个β折叠.序列一致性分析发现,斜带石斑鱼与澳洲肺鱼Neoceratodus forsteri、美洲拟鲽Limanda americanus、大西洋鲑Salmo salar、斑马鱼AMY基因序列相似性高达82.4%-91.8%,与人、小鼠、鸡G.Gallus的AMY基因相似性较低为70.1%-72.3%.斜带石斑鱼TRY和AMY基因cDNA全序列的成功克隆为进一步研究其表达调控机理及研发有效提高其表达水平的饲料添加剂奠定基础.
採用RT-PCR及RACE法從斜帶石斑魚Epinephelus coioides肝胰髒剋隆得到胰蛋白酶原(trypsinogen,TRY)與澱粉酶(amylase,AMY)基因cDNA全序列.斜帶石斑魚肝胰髒TRY基因cDNA全長911 bp,其中5非翻譯區(5'-UTR)為55bp,3'-UTR為127bp,開放閱讀框(ORF)為729bp,編碼242箇氨基痠,包含所有絲氨痠蛋白酶中共有的高度保守的催化活性中心.序列一緻性分析髮現,斜帶石斑魚與牙鲆Paralichthys olivaceus、金頭鯛Sparus aurata、鰨Solea senegalensis、石鰈Pleuronectes bicoloratus的TRY序列相似性高達86.8%-89.70%,與人Homo sapiens小鼠Mus musculus、斑馬魚Danio rerio的TRY相似性較低為59.9%-64.5%.斜帶石斑魚AMY基因cDNA全長1657bp,其中5'-UTR為41bp,3'-UTR為77 bp,ORF為1539bp,編碼512箇氨基痠,包含與哺乳動物α-AMY二級結構相似的8箇α鏇和8箇β摺疊.序列一緻性分析髮現,斜帶石斑魚與澳洲肺魚Neoceratodus forsteri、美洲擬鰈Limanda americanus、大西洋鮭Salmo salar、斑馬魚AMY基因序列相似性高達82.4%-91.8%,與人、小鼠、鷄G.Gallus的AMY基因相似性較低為70.1%-72.3%.斜帶石斑魚TRY和AMY基因cDNA全序列的成功剋隆為進一步研究其錶達調控機理及研髮有效提高其錶達水平的飼料添加劑奠定基礎.
채용RT-PCR급RACE법종사대석반어Epinephelus coioides간이장극륭득도이단백매원(trypsinogen,TRY)여정분매(amylase,AMY)기인cDNA전서렬.사대석반어간이장TRY기인cDNA전장911 bp,기중5비번역구(5'-UTR)위55bp,3'-UTR위127bp,개방열독광(ORF)위729bp,편마242개안기산,포함소유사안산단백매중공유적고도보수적최화활성중심.서렬일치성분석발현,사대석반어여아평Paralichthys olivaceus、금두조Sparus aurata、탑Solea senegalensis、석접Pleuronectes bicoloratus적TRY서렬상사성고체86.8%-89.70%,여인Homo sapiens소서Mus musculus、반마어Danio rerio적TRY상사성교저위59.9%-64.5%.사대석반어AMY기인cDNA전장1657bp,기중5'-UTR위41bp,3'-UTR위77 bp,ORF위1539bp,편마512개안기산,포함여포유동물α-AMY이급결구상사적8개α선화8개β절첩.서렬일치성분석발현,사대석반어여오주폐어Neoceratodus forsteri、미주의접Limanda americanus、대서양해Salmo salar、반마어AMY기인서렬상사성고체82.4%-91.8%,여인、소서、계G.Gallus적AMY기인상사성교저위70.1%-72.3%.사대석반어TRY화AMY기인cDNA전서렬적성공극륭위진일보연구기표체조공궤리급연발유효제고기표체수평적사료첨가제전정기출.