草业学报
草業學報
초업학보
PRATACULTURAL SCIENCE
2011年
4期
169-179
,共11页
王小利%刘晓霞%王舒颖%杨义成%吴佳海
王小利%劉曉霞%王舒穎%楊義成%吳佳海
왕소리%류효하%왕서영%양의성%오가해
高羊茅%腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因%克隆%表达分析
高羊茅%腺苷甲硫氨痠脫羧酶基因%剋隆%錶達分析
고양모%선감갑류안산탈최매기인%극륭%표체분석
在进行高羊茅光敏色素C基因5'端克隆时,筛选到腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因的5'端序列,根据5'端序列设计引物,扩增出该基因的3'端,拼接得到高羊茅腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因全序列,命名为Fa SAMDC(GenBank登录号:HQ606139),利用实时荧光定量PCR技术研究FaSAMDC基因在长日照与短日照条件下昼夜24 h的表达差异,为进一步揭示不同光周期调控FaSAMDC基因的表达奠定理论基础.FaSAMDC的cDNA全长1 964 bp,具有微型上游阅读框、小型上游阅读框和主阅读框3个开放阅读框,分别位于226~234,234~380和555~1 742 bp,微型上游阅读框和小型上游阅读框存在1个碱基重叠,主阅读框编码395个氨基酸,含有保守功能域:酶原剪切位点功能域和SAMDC蛋白快速降解有关的PEST功能域.对编码蛋白氨基酸序列的同源性分析表明,FaSAMDC与其他单子叶植物SAMDC蛋白的亲缘关系较近.在长日照和短日照处理条件下,FaSAMDC都具有3个表达峰.短日照处理条件下的表达峰比长日照处理条件下的表达峰早几个小时,但峰高低于长日照条件.由此说明,FaSAMDC基因的表达受光周期调控,与生物钟控制的昼夜节律有关.
在進行高羊茅光敏色素C基因5'耑剋隆時,篩選到腺苷甲硫氨痠脫羧酶基因的5'耑序列,根據5'耑序列設計引物,擴增齣該基因的3'耑,拼接得到高羊茅腺苷甲硫氨痠脫羧酶基因全序列,命名為Fa SAMDC(GenBank登錄號:HQ606139),利用實時熒光定量PCR技術研究FaSAMDC基因在長日照與短日照條件下晝夜24 h的錶達差異,為進一步揭示不同光週期調控FaSAMDC基因的錶達奠定理論基礎.FaSAMDC的cDNA全長1 964 bp,具有微型上遊閱讀框、小型上遊閱讀框和主閱讀框3箇開放閱讀框,分彆位于226~234,234~380和555~1 742 bp,微型上遊閱讀框和小型上遊閱讀框存在1箇堿基重疊,主閱讀框編碼395箇氨基痠,含有保守功能域:酶原剪切位點功能域和SAMDC蛋白快速降解有關的PEST功能域.對編碼蛋白氨基痠序列的同源性分析錶明,FaSAMDC與其他單子葉植物SAMDC蛋白的親緣關繫較近.在長日照和短日照處理條件下,FaSAMDC都具有3箇錶達峰.短日照處理條件下的錶達峰比長日照處理條件下的錶達峰早幾箇小時,但峰高低于長日照條件.由此說明,FaSAMDC基因的錶達受光週期調控,與生物鐘控製的晝夜節律有關.
재진행고양모광민색소C기인5'단극륭시,사선도선감갑류안산탈최매기인적5'단서렬,근거5'단서렬설계인물,확증출해기인적3'단,병접득도고양모선감갑류안산탈최매기인전서렬,명명위Fa SAMDC(GenBank등록호:HQ606139),이용실시형광정량PCR기술연구FaSAMDC기인재장일조여단일조조건하주야24 h적표체차이,위진일보게시불동광주기조공FaSAMDC기인적표체전정이론기출.FaSAMDC적cDNA전장1 964 bp,구유미형상유열독광、소형상유열독광화주열독광3개개방열독광,분별위우226~234,234~380화555~1 742 bp,미형상유열독광화소형상유열독광존재1개감기중첩,주열독광편마395개안기산,함유보수공능역:매원전절위점공능역화SAMDC단백쾌속강해유관적PEST공능역.대편마단백안기산서렬적동원성분석표명,FaSAMDC여기타단자협식물SAMDC단백적친연관계교근.재장일조화단일조처리조건하,FaSAMDC도구유3개표체봉.단일조처리조건하적표체봉비장일조처리조건하적표체봉조궤개소시,단봉고저우장일조조건.유차설명,FaSAMDC기인적표체수광주기조공,여생물종공제적주야절률유관.