食品科学
食品科學
식품과학
FOOD SCIENCE
2011年
3期
121-125
,共5页
林谦%杨胜远%陆兆新%吕凤霞%别小妹%邹晓葵
林謙%楊勝遠%陸兆新%呂鳳霞%彆小妹%鄒曉葵
림겸%양성원%륙조신%려봉하%별소매%추효규
嗜热链球菌%谷氨酸脱羧酶%γ-氨基丁酸%序列分析
嗜熱鏈毬菌%穀氨痠脫羧酶%γ-氨基丁痠%序列分析
기열련구균%곡안산탈최매%γ-안기정산%서렬분석
从嗜热链球菌Streptococcus thermophilus Y-2的谷氨酸脱羧酶基因(gadB)及其两侧旁邻序列出发,在GenBank中分别用Blastn、Blastx搜索同源序列.gadB在核酸水甲上无法找到同源序列,在蛋白质水平上与多种细菌的谷氨酸脱羧酶同源.根据谷氨酸脱羧酶的氨基酸序列构建系统发育树,菌株Y-2与具核梭杆菌Fusobacterium nucleatum subsp.polymorphum ATCC 10953的亲缘关系最近.gadB的上游侧翼区与嗜热链球菌LMG 18311的插入序列IS1216转座酶基因具有很高的相似性.gadB的下游侧翼区在核酸水平上未找到同源序列,在蛋白质水平上与谷氨酸/γ-氨基丁酸转运蛋白有很高的相似性.菌株Y-2的gadB、gadC排列方式与大肠杆菌、弗氏志贺菌的相同,而与乳酸乳球菌、短小乳杆菌的相反.在已完成全基因组测序的3个模式株Streptococcus thermophilus LMG 18311、CNRZ1066、LMD-9中均含有插入序列IS1216,但未发现谷氨酸脱羧酶基因gadB、谷氨酸/γ-氨基丁酸转运蛋白基因gadC.
從嗜熱鏈毬菌Streptococcus thermophilus Y-2的穀氨痠脫羧酶基因(gadB)及其兩側徬鄰序列齣髮,在GenBank中分彆用Blastn、Blastx搜索同源序列.gadB在覈痠水甲上無法找到同源序列,在蛋白質水平上與多種細菌的穀氨痠脫羧酶同源.根據穀氨痠脫羧酶的氨基痠序列構建繫統髮育樹,菌株Y-2與具覈梭桿菌Fusobacterium nucleatum subsp.polymorphum ATCC 10953的親緣關繫最近.gadB的上遊側翼區與嗜熱鏈毬菌LMG 18311的插入序列IS1216轉座酶基因具有很高的相似性.gadB的下遊側翼區在覈痠水平上未找到同源序列,在蛋白質水平上與穀氨痠/γ-氨基丁痠轉運蛋白有很高的相似性.菌株Y-2的gadB、gadC排列方式與大腸桿菌、弗氏誌賀菌的相同,而與乳痠乳毬菌、短小乳桿菌的相反.在已完成全基因組測序的3箇模式株Streptococcus thermophilus LMG 18311、CNRZ1066、LMD-9中均含有插入序列IS1216,但未髮現穀氨痠脫羧酶基因gadB、穀氨痠/γ-氨基丁痠轉運蛋白基因gadC.
종기열련구균Streptococcus thermophilus Y-2적곡안산탈최매기인(gadB)급기량측방린서렬출발,재GenBank중분별용Blastn、Blastx수색동원서렬.gadB재핵산수갑상무법조도동원서렬,재단백질수평상여다충세균적곡안산탈최매동원.근거곡안산탈최매적안기산서렬구건계통발육수,균주Y-2여구핵사간균Fusobacterium nucleatum subsp.polymorphum ATCC 10953적친연관계최근.gadB적상유측익구여기열련구균LMG 18311적삽입서렬IS1216전좌매기인구유흔고적상사성.gadB적하유측익구재핵산수평상미조도동원서렬,재단백질수평상여곡안산/γ-안기정산전운단백유흔고적상사성.균주Y-2적gadB、gadC배렬방식여대장간균、불씨지하균적상동,이여유산유구균、단소유간균적상반.재이완성전기인조측서적3개모식주Streptococcus thermophilus LMG 18311、CNRZ1066、LMD-9중균함유삽입서렬IS1216,단미발현곡안산탈최매기인gadB、곡안산/γ-안기정산전운단백기인gadC.
