神经科学通报(英文版)
神經科學通報(英文版)
신경과학통보(영문판)
NEUROSCIENCE BULLETIN
2007年
1期
9-20
,共12页
胡亚欧%孙阳%叶波平%王大勇
鬍亞歐%孫暘%葉波平%王大勇
호아구%손양%협파평%왕대용
microRNA%化学传感器结构%感觉神经元%中间神经元%生物信息学分析%秀丽线虫
microRNA%化學傳感器結構%感覺神經元%中間神經元%生物信息學分析%秀麗線蟲
microRNA%화학전감기결구%감각신경원%중간신경원%생물신식학분석%수려선충
microRNA%cilia structure%sensory neuron%interneuron%computational analysis%C.elegans
目的 为了系统评价microRNA(miRNA)在调控化学传感器结构和功能方面的重要作用,我们进行了线虫中有关影响化学传感器结构与功能的遗传位点以及和其可能对应的miRNA的生物信息学分析.方法 我们选择了55个与化学传感器结构与功能相关的遗传位点,并且进一步通过评价序列比对后的E值等手段来分析和确认其可能对应的miRNA.结果 在55个遗传位点中,我们发现其中30个遗传位点存在与其可能对应的miRNA.这些所鉴定的基因在功能上几乎涵盖了化学传感器结构和功能调控的诸多方面.而且,我们的数据还表明化学传感器结构和功能可能受到一系列网状交联的上游信号通路所调节.另外,对应miRNA在这30个基因的3'端非编码区上的分布也呈现出各自特有的模式.结论 我们勾勒出了可能存在的由miRNA介导的通过控制相应感觉神经元与中间神经元功能从而调控化学趋向性与温度趋向性的信号通路.本研究将有助于我们更好的了解线虫中可能由miRNA调控的化学趋向性和温度趋向性行为.
目的 為瞭繫統評價microRNA(miRNA)在調控化學傳感器結構和功能方麵的重要作用,我們進行瞭線蟲中有關影響化學傳感器結構與功能的遺傳位點以及和其可能對應的miRNA的生物信息學分析.方法 我們選擇瞭55箇與化學傳感器結構與功能相關的遺傳位點,併且進一步通過評價序列比對後的E值等手段來分析和確認其可能對應的miRNA.結果 在55箇遺傳位點中,我們髮現其中30箇遺傳位點存在與其可能對應的miRNA.這些所鑒定的基因在功能上幾乎涵蓋瞭化學傳感器結構和功能調控的諸多方麵.而且,我們的數據還錶明化學傳感器結構和功能可能受到一繫列網狀交聯的上遊信號通路所調節.另外,對應miRNA在這30箇基因的3'耑非編碼區上的分佈也呈現齣各自特有的模式.結論 我們勾勒齣瞭可能存在的由miRNA介導的通過控製相應感覺神經元與中間神經元功能從而調控化學趨嚮性與溫度趨嚮性的信號通路.本研究將有助于我們更好的瞭解線蟲中可能由miRNA調控的化學趨嚮性和溫度趨嚮性行為.
목적 위료계통평개microRNA(miRNA)재조공화학전감기결구화공능방면적중요작용,아문진행료선충중유관영향화학전감기결구여공능적유전위점이급화기가능대응적miRNA적생물신식학분석.방법 아문선택료55개여화학전감기결구여공능상관적유전위점,병차진일보통과평개서렬비대후적E치등수단래분석화학인기가능대응적miRNA.결과 재55개유전위점중,아문발현기중30개유전위점존재여기가능대응적miRNA.저사소감정적기인재공능상궤호함개료화학전감기결구화공능조공적제다방면.이차,아문적수거환표명화학전감기결구화공능가능수도일계렬망상교련적상유신호통로소조절.령외,대응miRNA재저30개기인적3'단비편마구상적분포야정현출각자특유적모식.결론 아문구륵출료가능존재적유miRNA개도적통과공제상응감각신경원여중간신경원공능종이조공화학추향성여온도추향성적신호통로.본연구장유조우아문경호적료해선충중가능유miRNA조공적화학추향성화온도추향성행위.
Objective To examine the important roles of microRNAs (miRNAs) in regulating amphid structure and function,we performed a computational analysis for the genetic loci required for the sensory perception and their possibly Corresponding miRNAs in C. elegans. Methods Total 55 genetic loci required for the amphid structure and function were selected. Sequence alignment was combined with E value evaluation to investigate and identify the possible corresponding miRNAs. Results Total 30 genes among the 55 genetic loci selected have their possible corresponding regulatory miRNA(s), and identified genes participate in the regulation of almost all aspects of amphid structure and function. In addition, our data suggest that both the amphid structure and the amphid functions might be regulated by a series of network signaling pathways. Moreover, the distribution of miRNAs along the 3' untranslated region (UTR) of these 30 genes exhibits different patterns. Conclusion We present the possible miRNA-mediated signaling pathways involved in the regulation of chemosensation and thermosensation by controlling the corresponding sensory neuron and interneuron functions. Our work will be useful for better understanding of the miRNA-mediated control of the chemotaxis and thermotaxis in C. elegans.