CAJ | 학술논문

以火炬松热胁迫cDNA文库的EST序列为材料,对EST序列进行聚类、拼接等处理后,再进行EST-SSR标记的预测.结果表明:火炬松热胁迫eDNA文库4 283条EST序列经CAP3拼接后,获得2 062个UniGene,其中934个Contig,1 128个Singletons.对UniGene利用SSRIT在线软件分析得到110条EST-SSR.拼接后的UniGene含有SSR位点的频率为4.32%,SSR在火炬松EST上的分布密度为每14.6 kb出现1个SSR.这些EST重复基元中,二核苷酸重复和三核苷酸重复最多,分别占60.90%和36.36%;四、六核苷酸重复分别占0.91%、2.73%;没有五核苷酸的重复基序.所有的核苷酸重复基元中,二核苷酸AT所占比例最高,约占42.73%;三核苷酸重复中,比例最高的是AAG和AGG,均占7.33%.上述研究结果对于开发火炬松新分子标记与开展分子辅助育种的研究具有一定的指导意义.
이화거송열협박cDNA문고적EST서렬위재료,대EST서렬진행취류、병접등처리후,재진행EST-SSR표기적예측.결과표명:화거송열협박eDNA문고4 283조EST서렬경CAP3병접후,획득2 062개UniGene,기중934개Contig,1 128개Singletons.대UniGene이용SSRIT재선연건분석득도110조EST-SSR.병접후적UniGene함유SSR위점적빈솔위4.32%,SSR재화거송EST상적분포밀도위매14.6 kb출현1개SSR.저사EST중복기원중,이핵감산중복화삼핵감산중복최다,분별점60.90%화36.36%;사、륙핵감산중복분별점0.91%、2.73%;몰유오핵감산적중복기서.소유적핵감산중복기원중,이핵감산AT소점비례최고,약점42.73%;삼핵감산중복중,비례최고적시AAG화AGG,균점7.33%.상술연구결과대우개발화거송신분자표기여개전분자보조육충적연구구유일정적지도의의.