曲阜师范大学学报（自然科学版）
麯阜師範大學學報（自然科學版）
곡부사범대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF QUFU NORMAL UNIVERSITY (NATURAL SCIENCE EDITION)
2012年
1期
85-90
,共6页
郑莹莹%徐来祥%徐金会%薛慧良%陈蕾
鄭瑩瑩%徐來祥%徐金會%薛慧良%陳蕾
정형형%서래상%서금회%설혜량%진뢰
黑线仓鼠%PPARβ%克隆%序列结构%系统进化%空间结构%锌指结构
黑線倉鼠%PPARβ%剋隆%序列結構%繫統進化%空間結構%鋅指結構
흑선창서%PPARβ%극륭%서렬결구%계통진화%공간결구%자지결구
参考黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)近缘种PPARβ的cDNA序列设计引物,采用RT-PCR法克隆得到黑线仓鼠PPARβ部分序列,并翻译成氨基酸.利用该结果与其他物种核苷酸及氨基酸序列进行相似性比较、构建系统进化树、一级结构分析、二级结构和空间结构预测.结果表明:得到的480 bp PPAR序列包括部分外显子4,全部外显子5、6及部分外显子7；共编码159个氨基酸；除人之外,黑线仓鼠PPARβ基因与其他物种的核苷酸相似性均在88％ -94％之间,氨基酸相似性均在90％以上；构建进化树得出,黑线仓鼠与鼠类亲缘关系最近,与人的亲缘关系最远；疏水性分析、二级结构预显示该编码区亲水性较强；二级结构、空间结构预测显示该序列含α螺旋较多；空间结构预测看出该段区域含两个典型的锌指结构.
參攷黑線倉鼠(Cricetulus barabensis)近緣種PPARβ的cDNA序列設計引物,採用RT-PCR法剋隆得到黑線倉鼠PPARβ部分序列,併翻譯成氨基痠.利用該結果與其他物種覈苷痠及氨基痠序列進行相似性比較、構建繫統進化樹、一級結構分析、二級結構和空間結構預測.結果錶明:得到的480 bp PPAR序列包括部分外顯子4,全部外顯子5、6及部分外顯子7；共編碼159箇氨基痠；除人之外,黑線倉鼠PPARβ基因與其他物種的覈苷痠相似性均在88％ -94％之間,氨基痠相似性均在90％以上；構建進化樹得齣,黑線倉鼠與鼠類親緣關繫最近,與人的親緣關繫最遠；疏水性分析、二級結構預顯示該編碼區親水性較彊；二級結構、空間結構預測顯示該序列含α螺鏇較多；空間結構預測看齣該段區域含兩箇典型的鋅指結構.
삼고흑선창서(Cricetulus barabensis)근연충PPARβ적cDNA서렬설계인물,채용RT-PCR법극륭득도흑선창서PPARβ부분서렬,병번역성안기산.이용해결과여기타물충핵감산급안기산서렬진행상사성비교、구건계통진화수、일급결구분석、이급결구화공간결구예측.결과표명:득도적480 bp PPAR서렬포괄부분외현자4,전부외현자5、6급부분외현자7；공편마159개안기산；제인지외,흑선창서PPARβ기인여기타물충적핵감산상사성균재88％ -94％지간,안기산상사성균재90％이상；구건진화수득출,흑선창서여서류친연관계최근,여인적친연관계최원；소수성분석、이급결구예현시해편마구친수성교강；이급결구、공간결구예측현시해서렬함α라선교다；공간결구예측간출해단구역함량개전형적자지결구.
