生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2003年
5期
798-802
,共5页
吴襟%于炜婷%王辉%刘莉%王绍校%张树政
吳襟%于煒婷%王輝%劉莉%王紹校%張樹政
오금%우위정%왕휘%류리%왕소교%장수정
芝田硫化叶菌%海藻糖%酶%基因克隆%序列分析
芝田硫化葉菌%海藻糖%酶%基因剋隆%序列分析
지전류화협균%해조당%매%기인극륭%서렬분석
从耐热古菌海藻糖芝田硫化叶菌B12中分别克隆出海藻糖生成相关酶--麦芽寡糖基海藻糖合酶的基因treY和麦芽寡糖基海藻糖基水解酶的基因treZ,测定了其核苷酸序列并进行了表达.其中treY编码的蛋白质有728个氨基酸、分子质量为86 ku;treZ编码的蛋白质有559个氨基酸、分子质量为65 ku.它们与已报道的其他微生物的两个海藻糖生成相关酶的基因进行同源性比较,treY和treZ的同源性分别为93%和76%(硫矿硫化叶菌P2)、97%和95%(硫矿硫化叶菌KM1)、63%和66%(嗜酸热硫化叶菌ATCC33909)、48%和50%(节杆菌Q36)、48%和52%(根瘤菌M11)、50%和52%(短杆菌).通过PHYLIP软件进行这些基因序列的分类聚类计算,获得这几种微生物间两个酶类的蛋白质系统进化树;经过氨基酸序列比较分析还发现,所有的海藻糖生成相关酶都含有糖苷酶家族13中几个高度保守的α-淀粉酶催化活性区,推测这些海藻糖生成相关酶都可能有着共同的进化来源.
從耐熱古菌海藻糖芝田硫化葉菌B12中分彆剋隆齣海藻糖生成相關酶--麥芽寡糖基海藻糖閤酶的基因treY和麥芽寡糖基海藻糖基水解酶的基因treZ,測定瞭其覈苷痠序列併進行瞭錶達.其中treY編碼的蛋白質有728箇氨基痠、分子質量為86 ku;treZ編碼的蛋白質有559箇氨基痠、分子質量為65 ku.它們與已報道的其他微生物的兩箇海藻糖生成相關酶的基因進行同源性比較,treY和treZ的同源性分彆為93%和76%(硫礦硫化葉菌P2)、97%和95%(硫礦硫化葉菌KM1)、63%和66%(嗜痠熱硫化葉菌ATCC33909)、48%和50%(節桿菌Q36)、48%和52%(根瘤菌M11)、50%和52%(短桿菌).通過PHYLIP軟件進行這些基因序列的分類聚類計算,穫得這幾種微生物間兩箇酶類的蛋白質繫統進化樹;經過氨基痠序列比較分析還髮現,所有的海藻糖生成相關酶都含有糖苷酶傢族13中幾箇高度保守的α-澱粉酶催化活性區,推測這些海藻糖生成相關酶都可能有著共同的進化來源.
종내열고균해조당지전류화협균B12중분별극륭출해조당생성상관매--맥아과당기해조당합매적기인treY화맥아과당기해조당기수해매적기인treZ,측정료기핵감산서렬병진행료표체.기중treY편마적단백질유728개안기산、분자질량위86 ku;treZ편마적단백질유559개안기산、분자질량위65 ku.타문여이보도적기타미생물적량개해조당생성상관매적기인진행동원성비교,treY화treZ적동원성분별위93%화76%(류광류화협균P2)、97%화95%(류광류화협균KM1)、63%화66%(기산열류화협균ATCC33909)、48%화50%(절간균Q36)、48%화52%(근류균M11)、50%화52%(단간균).통과PHYLIP연건진행저사기인서렬적분류취류계산,획득저궤충미생물간량개매류적단백질계통진화수;경과안기산서렬비교분석환발현,소유적해조당생성상관매도함유당감매가족13중궤개고도보수적α-정분매최화활성구,추측저사해조당생성상관매도가능유착공동적진화래원.
