蚕业科学
蠶業科學
잠업과학
ACTA SERICOLOGICA SINICA
2004年
2期
151-156
,共6页
陈大福%牛宝龙%翁宏飚%孟智启%吕顺霖
陳大福%牛寶龍%翁宏飚%孟智啟%呂順霖
진대복%우보룡%옹굉표%맹지계%려순림
家蚕%EST数据库%RT-PCR%腺苷酸转移酶
傢蠶%EST數據庫%RT-PCR%腺苷痠轉移酶
가잠%EST수거고%RT-PCR%선감산전이매
根据物种间同源基因相对保守的特点,利用生物信息学方法以果蝇(Drosophila melanogaster)腺苷酸转移酶基因(adenine nucleotide translocase, ant) cDNA序列作为模板,对家蚕(Bombyx mori) EST数据库进行同源检索筛选,克隆了家蚕腺苷酸转移酶基因的cDNA序列(GenBank登录号为AY227000),全长为1 936 bp,并经RT-PCR克隆、序列分析验证,结果与电子克隆序列完全一致.该cDNA序列具有完整的开放阅读框架(ORF, 207～1 109 bp),推测编码蛋白为300个氨基酸,通过与烟草天蛾(Manduca sexta)、蜜蜂(Apis mellifera)、绿蝇(Lucilia cuprina)、果蝇、蚊子(Anopheles gambiae)等昆虫的腺苷酸转移酶蛋白序列比较,发现该基因具有高度的保守性.表明根据物种间同源基因序列,对跨物种间EST数据库进行同源检索筛选、拼接,是基因克隆的一条有效途径.
根據物種間同源基因相對保守的特點,利用生物信息學方法以果蠅(Drosophila melanogaster)腺苷痠轉移酶基因(adenine nucleotide translocase, ant) cDNA序列作為模闆,對傢蠶(Bombyx mori) EST數據庫進行同源檢索篩選,剋隆瞭傢蠶腺苷痠轉移酶基因的cDNA序列(GenBank登錄號為AY227000),全長為1 936 bp,併經RT-PCR剋隆、序列分析驗證,結果與電子剋隆序列完全一緻.該cDNA序列具有完整的開放閱讀框架(ORF, 207～1 109 bp),推測編碼蛋白為300箇氨基痠,通過與煙草天蛾(Manduca sexta)、蜜蜂(Apis mellifera)、綠蠅(Lucilia cuprina)、果蠅、蚊子(Anopheles gambiae)等昆蟲的腺苷痠轉移酶蛋白序列比較,髮現該基因具有高度的保守性.錶明根據物種間同源基因序列,對跨物種間EST數據庫進行同源檢索篩選、拼接,是基因剋隆的一條有效途徑.
근거물충간동원기인상대보수적특점,이용생물신식학방법이과승(Drosophila melanogaster)선감산전이매기인(adenine nucleotide translocase, ant) cDNA서렬작위모판,대가잠(Bombyx mori) EST수거고진행동원검색사선,극륭료가잠선감산전이매기인적cDNA서렬(GenBank등록호위AY227000),전장위1 936 bp,병경RT-PCR극륭、서렬분석험증,결과여전자극륭서렬완전일치.해cDNA서렬구유완정적개방열독광가(ORF, 207～1 109 bp),추측편마단백위300개안기산,통과여연초천아(Manduca sexta)、밀봉(Apis mellifera)、록승(Lucilia cuprina)、과승、문자(Anopheles gambiae)등곤충적선감산전이매단백서렬비교,발현해기인구유고도적보수성.표명근거물충간동원기인서렬,대과물충간EST수거고진행동원검색사선、병접,시기인극륭적일조유효도경.
