武汉植物学研究
武漢植物學研究
무한식물학연구
JOURNAL OF WUHAN BOTANICAL RESEARCH
2009年
2期
188-192
,共5页
张玉宝%郭志鸿%李同祥%王亚军%谢忠奎
張玉寶%郭誌鴻%李同祥%王亞軍%謝忠奎
장옥보%곽지홍%리동상%왕아군%사충규
DRE顺式作用元件%DREB转录因子%双链DNA芯片
DRE順式作用元件%DREB轉錄因子%雙鏈DNA芯片
DRE순식작용원건%DREB전록인자%쌍련DNA심편
DRE顺式作用元件能与DREB转录因子特异结合,在诱导逆境(干旱、高盐、低温)基因表达过程中起重要作用.dsDNA(double strand DNA)微阵列芯片技术能够有效地检测序列特异性DNA 结合蛋白质(转录因子)与大量DNA 靶点(顺式作用元件)的特异性结合,可有效分析生物分子结合作用.根据DRE顺式作用元件核心序列设计并化学合成含发夹结构的单链DNA探针,采用Taq DNA聚合酶在片延伸,并对其在片延伸体系的反应温度、Mg2+浓度以及单链探针是否变性等条件进行了优化.结果表明,50℃的反应温度,2.5 mmol/L的Mg2+浓度和单链不变性是Taq DNA聚合酶在片延伸的最佳条件.优化方法制备的dsDNA芯片将更有利于DRE顺式作用元件与DREB抗逆转录因子相互作用的研究.
DRE順式作用元件能與DREB轉錄因子特異結閤,在誘導逆境(榦旱、高鹽、低溫)基因錶達過程中起重要作用.dsDNA(double strand DNA)微陣列芯片技術能夠有效地檢測序列特異性DNA 結閤蛋白質(轉錄因子)與大量DNA 靶點(順式作用元件)的特異性結閤,可有效分析生物分子結閤作用.根據DRE順式作用元件覈心序列設計併化學閤成含髮夾結構的單鏈DNA探針,採用Taq DNA聚閤酶在片延伸,併對其在片延伸體繫的反應溫度、Mg2+濃度以及單鏈探針是否變性等條件進行瞭優化.結果錶明,50℃的反應溫度,2.5 mmol/L的Mg2+濃度和單鏈不變性是Taq DNA聚閤酶在片延伸的最佳條件.優化方法製備的dsDNA芯片將更有利于DRE順式作用元件與DREB抗逆轉錄因子相互作用的研究.
DRE순식작용원건능여DREB전록인자특이결합,재유도역경(간한、고염、저온)기인표체과정중기중요작용.dsDNA(double strand DNA)미진렬심편기술능구유효지검측서렬특이성DNA 결합단백질(전록인자)여대량DNA 파점(순식작용원건)적특이성결합,가유효분석생물분자결합작용.근거DRE순식작용원건핵심서렬설계병화학합성함발협결구적단련DNA탐침,채용Taq DNA취합매재편연신,병대기재편연신체계적반응온도、Mg2+농도이급단련탐침시부변성등조건진행료우화.결과표명,50℃적반응온도,2.5 mmol/L적Mg2+농도화단련불변성시Taq DNA취합매재편연신적최가조건.우화방법제비적dsDNA심편장경유리우DRE순식작용원건여DREB항역전록인자상호작용적연구.