中国骨质疏松杂志
中國骨質疏鬆雜誌
중국골질소송잡지
CHINESE JOURNAL OF OSTEOPOROSIS
2011年
4期
279-290
,共12页
张治国%牛旭艳%刘梅洁%李艳%吕爱平%鞠大宏
張治國%牛旭豔%劉梅潔%李豔%呂愛平%鞠大宏
장치국%우욱염%류매길%리염%려애평%국대굉
骨质疏松症%在线人类孟德尔遗传数据库%蛋白质相互作用网络%分子复合物%基因本体论
骨質疏鬆癥%在線人類孟德爾遺傳數據庫%蛋白質相互作用網絡%分子複閤物%基因本體論
골질소송증%재선인류맹덕이유전수거고%단백질상호작용망락%분자복합물%기인본체론
目的 建立基于骨质疏松症遗传相关基因的蛋白质相互作用网络,发现其中其中包含的分子复合物和未经研究或研究较少的与骨质疏松症相关的蛋白质.方法 基于OMIM数据库中与骨质疏松症发生相关的177个遗传基因,应用 Cytoscape软件及其插件Agilent Literature Search,进行PUBMED文献的文本数据挖掘,建立骨质疏松症的蛋白质相互作用网络;应用MCOMD算法,探测网络中的分子复合物,并对分子复合物包含的蛋白质进行GO分析,分析包括分子功能、生物学通路、细胞组分.结果 骨质疏松症的蛋白质相互作用网络包含863个节点(蛋白质)、2925条边(相互作用关系)、4个高度关联的分子复合物.这些分子复合物内的18个蛋白质与骨质疏松症的关系未经研究或研究较少.结论 基于OMIM数据库,可建立骨质疏松症的蛋白质相互作用网络,发现未经研究或研究较少的骨质疏松症关联蛋白质.
目的 建立基于骨質疏鬆癥遺傳相關基因的蛋白質相互作用網絡,髮現其中其中包含的分子複閤物和未經研究或研究較少的與骨質疏鬆癥相關的蛋白質.方法 基于OMIM數據庫中與骨質疏鬆癥髮生相關的177箇遺傳基因,應用 Cytoscape軟件及其插件Agilent Literature Search,進行PUBMED文獻的文本數據挖掘,建立骨質疏鬆癥的蛋白質相互作用網絡;應用MCOMD算法,探測網絡中的分子複閤物,併對分子複閤物包含的蛋白質進行GO分析,分析包括分子功能、生物學通路、細胞組分.結果 骨質疏鬆癥的蛋白質相互作用網絡包含863箇節點(蛋白質)、2925條邊(相互作用關繫)、4箇高度關聯的分子複閤物.這些分子複閤物內的18箇蛋白質與骨質疏鬆癥的關繫未經研究或研究較少.結論 基于OMIM數據庫,可建立骨質疏鬆癥的蛋白質相互作用網絡,髮現未經研究或研究較少的骨質疏鬆癥關聯蛋白質.
목적 건립기우골질소송증유전상관기인적단백질상호작용망락,발현기중기중포함적분자복합물화미경연구혹연구교소적여골질소송증상관적단백질.방법 기우OMIM수거고중여골질소송증발생상관적177개유전기인,응용 Cytoscape연건급기삽건Agilent Literature Search,진행PUBMED문헌적문본수거알굴,건립골질소송증적단백질상호작용망락;응용MCOMD산법,탐측망락중적분자복합물,병대분자복합물포함적단백질진행GO분석,분석포괄분자공능、생물학통로、세포조분.결과 골질소송증적단백질상호작용망락포함863개절점(단백질)、2925조변(상호작용관계)、4개고도관련적분자복합물.저사분자복합물내적18개단백질여골질소송증적관계미경연구혹연구교소.결론 기우OMIM수거고,가건립골질소송증적단백질상호작용망락,발현미경연구혹연구교소적골질소송증관련단백질.
