广西植物
廣西植物
엄서식물
GUIHAIA
2012年
2期
231-237,172
,共8页
韦传宝%华俊雅%杨宇%隗洋洋%史利利
韋傳寶%華俊雅%楊宇%隗洋洋%史利利
위전보%화준아%양우%외양양%사리리
韭葱黄条病毒%洋葱黄矮病毒%胡葱黄条病毒%CP基因%序列分析
韭蔥黃條病毒%洋蔥黃矮病毒%鬍蔥黃條病毒%CP基因%序列分析
구총황조병독%양총황왜병독%호총황조병독%CP기인%서렬분석
设计特异性引物PCR扩增了六安大蒜病样中的韭葱黄条病毒(Leek yellow stripe virus,LYSV)、洋葱黄矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)和胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的全长CP基因,插入到pGEM-T载体并测序.分别比较3种病毒CP基因种内变异性和种间亲缘关系.结果表明LYSV六安分离物CP基因由864个碱基组成,与Genbank上已报道的68个LYSV不同分离物CP基因的核苷酸序列同源性为76.12%～84.31%;OYDV的CP基因由771个碱基组成,与Genbank上已报道的86个OYDV不同分离物同源性为81.06%～90.40%;SYSV的CP基因由774个碱基组成,与Genbank上已报道的11个SYSV不同分离物CP基因同源性为88.63%～94.32%;从分析结果来看,LYSV的CP基因不同分离物之间变异性较大,OYDV CP变异性不大,SYSV变异性很小;3种病毒都有1个以上的宿主,病毒种内不同宿主分离物之间CP序列差异很小.进化分析显示OYDV和SYSV的CP基因亲缘性较近并成簇,LYSV的CP基因与OYDV和LYSV的CP基因亲缘性较远.
設計特異性引物PCR擴增瞭六安大蒜病樣中的韭蔥黃條病毒(Leek yellow stripe virus,LYSV)、洋蔥黃矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)和鬍蔥黃條病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的全長CP基因,插入到pGEM-T載體併測序.分彆比較3種病毒CP基因種內變異性和種間親緣關繫.結果錶明LYSV六安分離物CP基因由864箇堿基組成,與Genbank上已報道的68箇LYSV不同分離物CP基因的覈苷痠序列同源性為76.12%～84.31%;OYDV的CP基因由771箇堿基組成,與Genbank上已報道的86箇OYDV不同分離物同源性為81.06%～90.40%;SYSV的CP基因由774箇堿基組成,與Genbank上已報道的11箇SYSV不同分離物CP基因同源性為88.63%～94.32%;從分析結果來看,LYSV的CP基因不同分離物之間變異性較大,OYDV CP變異性不大,SYSV變異性很小;3種病毒都有1箇以上的宿主,病毒種內不同宿主分離物之間CP序列差異很小.進化分析顯示OYDV和SYSV的CP基因親緣性較近併成簇,LYSV的CP基因與OYDV和LYSV的CP基因親緣性較遠.
설계특이성인물PCR확증료륙안대산병양중적구총황조병독(Leek yellow stripe virus,LYSV)、양총황왜병독(Onion yellow dwarf virus,OYDV)화호총황조병독(Shallot yellow stripe virus,SYSV)적전장CP기인,삽입도pGEM-T재체병측서.분별비교3충병독CP기인충내변이성화충간친연관계.결과표명LYSV륙안분리물CP기인유864개감기조성,여Genbank상이보도적68개LYSV불동분리물CP기인적핵감산서렬동원성위76.12%～84.31%;OYDV적CP기인유771개감기조성,여Genbank상이보도적86개OYDV불동분리물동원성위81.06%～90.40%;SYSV적CP기인유774개감기조성,여Genbank상이보도적11개SYSV불동분리물CP기인동원성위88.63%～94.32%;종분석결과래간,LYSV적CP기인불동분리물지간변이성교대,OYDV CP변이성불대,SYSV변이성흔소;3충병독도유1개이상적숙주,병독충내불동숙주분리물지간CP서렬차이흔소.진화분석현시OYDV화SYSV적CP기인친연성교근병성족,LYSV적CP기인여OYDV화LYSV적CP기인친연성교원.
