安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2011年
36期
22217-22219,22276
,共4页
冯怡%张智俊%张舍龙%罗淑萍
馮怡%張智俊%張捨龍%囉淑萍
풍이%장지준%장사룡%라숙평
胡桃%EST-SSR%微卫星%引物
鬍桃%EST-SSR%微衛星%引物
호도%EST-SSR%미위성%인물
[目的]筛选胡桃的EST-SSR分子标记并对其进行引物设计.[方法]利用生物信息学方法对NCBI网上公开的5213条胡桃(Juglans regia Linn.)ESTs序列进行EST-SSR特征分析,利用Primer 3.0软件对筛选出的EST序列设计引物.[结果]在ESTs序列中共检索出207个SSR,其中无冗余序列188,检出率为3.97％,平均分布距离为21.12 kb,包括92种重复基元,其中以二核苷酸和三核苷酸重复类型为主,分别占总数目的31.40％和35.27％;对随机筛选出的50条SSR引物进行PCR扩增验证,初步筛选出30对引物.[结论]通过对胡桃EST序列中SSR位点的发掘分析,有针对性地设计EST-SSR引物,将为胡桃科EST-SSR分子标记的开发奠定基础.
[目的]篩選鬍桃的EST-SSR分子標記併對其進行引物設計.[方法]利用生物信息學方法對NCBI網上公開的5213條鬍桃(Juglans regia Linn.)ESTs序列進行EST-SSR特徵分析,利用Primer 3.0軟件對篩選齣的EST序列設計引物.[結果]在ESTs序列中共檢索齣207箇SSR,其中無冗餘序列188,檢齣率為3.97％,平均分佈距離為21.12 kb,包括92種重複基元,其中以二覈苷痠和三覈苷痠重複類型為主,分彆佔總數目的31.40％和35.27％;對隨機篩選齣的50條SSR引物進行PCR擴增驗證,初步篩選齣30對引物.[結論]通過對鬍桃EST序列中SSR位點的髮掘分析,有針對性地設計EST-SSR引物,將為鬍桃科EST-SSR分子標記的開髮奠定基礎.
[목적]사선호도적EST-SSR분자표기병대기진행인물설계.[방법]이용생물신식학방법대NCBI망상공개적5213조호도(Juglans regia Linn.)ESTs서렬진행EST-SSR특정분석,이용Primer 3.0연건대사선출적EST서렬설계인물.[결과]재ESTs서렬중공검색출207개SSR,기중무용여서렬188,검출솔위3.97％,평균분포거리위21.12 kb,포괄92충중복기원,기중이이핵감산화삼핵감산중복류형위주,분별점총수목적31.40％화35.27％;대수궤사선출적50조SSR인물진행PCR확증험증,초보사선출30대인물.[결론]통과대호도EST서렬중SSR위점적발굴분석,유침대성지설계EST-SSR인물,장위호도과EST-SSR분자표기적개발전정기출.
