计算机工程与科学
計算機工程與科學
계산궤공정여과학
COMPUTER ENGINEERING & SCIENCE
2011年
12期
148-152
,共5页
蛋白质功能预测%支持向量机%LPU
蛋白質功能預測%支持嚮量機%LPU
단백질공능예측%지지향량궤%LPU
本文将蛋白质功能预测定义为典型的LPU问题.针对有很少正例的LPU算法存在的不平衡或过拟合问题,提出了基于最近邻和凸组合理论的创建人工正例扩充正例集合的方法,同时使用一类支持向量机获取初始最可能的负例,通过迭代两类支持向量机将分类超平面移到一个合适的位置,由交叉验证获得代表性的负例,从而改进了典型LPU算法学习最优分类器的过程.针对酵母基因组数据的实验表明:我们的算法在很少正例的功能类上的预测性能有显著提高,在其他类上的性能也有一定的改善.
本文將蛋白質功能預測定義為典型的LPU問題.針對有很少正例的LPU算法存在的不平衡或過擬閤問題,提齣瞭基于最近鄰和凸組閤理論的創建人工正例擴充正例集閤的方法,同時使用一類支持嚮量機穫取初始最可能的負例,通過迭代兩類支持嚮量機將分類超平麵移到一箇閤適的位置,由交扠驗證穫得代錶性的負例,從而改進瞭典型LPU算法學習最優分類器的過程.針對酵母基因組數據的實驗錶明:我們的算法在很少正例的功能類上的預測性能有顯著提高,在其他類上的性能也有一定的改善.
본문장단백질공능예측정의위전형적LPU문제.침대유흔소정례적LPU산법존재적불평형혹과의합문제,제출료기우최근린화철조합이론적창건인공정례확충정례집합적방법,동시사용일류지지향량궤획취초시최가능적부례,통과질대량류지지향량궤장분류초평면이도일개합괄적위치,유교차험증획득대표성적부례,종이개진료전형LPU산법학습최우분류기적과정.침대효모기인조수거적실험표명:아문적산법재흔소정례적공능류상적예측성능유현저제고,재기타류상적성능야유일정적개선.
