中国人兽共患病杂志
中國人獸共患病雜誌
중국인수공환병잡지
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2004年
1期
5-9,4
,共6页
耿燕%郭晓奎%张怡轩%缪有刚%何建勇%赵国屏
耿燕%郭曉奎%張怡軒%繆有剛%何建勇%趙國屏
경연%곽효규%장이헌%무유강%하건용%조국병
问号钩体%LPS%生物合成%生物信息学
問號鉤體%LPS%生物閤成%生物信息學
문호구체%LPS%생물합성%생물신식학
目的预测问号钩体黄疸出血型赖株脂多糖(LPS)合成、装配途径,并对其中几个关键基因的特征进行深入分析.方法使用NCBI/BlastX,ProDom/Blast,Jpred2,TMHMM对问号钩体黄疸出血型赖株全基因组ORF基因所编码蛋白进行在线分析,并使用Bioedit,Pep Tool软件进行蛋白质一、二级结构分析.结果确定了脂质A和核心多糖生物合成基因lpxA、lpxB、lpxC、lpxD、lpxK、kdsA、kdsB、kdtA、lnt、htrB和O-抗原生物合成基因簇rfb locus 等以及装配、跨膜转运中的基因rfbP、rfbX、rfc、rfaL、rfe绘制了LPS合成及装配途径示意图.并对合成和装配途径中几个关键的基因编码蛋白(LpxA、 Rfc、 RfbX、 RfaL)的二级结构、跨膜区域、结构域等进行了分析.结论问号钩体黄疸出血型赖株LPS合成、装配途径与典型的革兰阴性菌,如大肠埃希菌K-12相似,主要差异在于钩体特殊的脂肪酸代谢途径和O-抗原多糖结构.该研究为进一步探讨钩体LPS基因功能及其与致病性关系奠定基础.
目的預測問號鉤體黃疸齣血型賴株脂多糖(LPS)閤成、裝配途徑,併對其中幾箇關鍵基因的特徵進行深入分析.方法使用NCBI/BlastX,ProDom/Blast,Jpred2,TMHMM對問號鉤體黃疸齣血型賴株全基因組ORF基因所編碼蛋白進行在線分析,併使用Bioedit,Pep Tool軟件進行蛋白質一、二級結構分析.結果確定瞭脂質A和覈心多糖生物閤成基因lpxA、lpxB、lpxC、lpxD、lpxK、kdsA、kdsB、kdtA、lnt、htrB和O-抗原生物閤成基因簇rfb locus 等以及裝配、跨膜轉運中的基因rfbP、rfbX、rfc、rfaL、rfe繪製瞭LPS閤成及裝配途徑示意圖.併對閤成和裝配途徑中幾箇關鍵的基因編碼蛋白(LpxA、 Rfc、 RfbX、 RfaL)的二級結構、跨膜區域、結構域等進行瞭分析.結論問號鉤體黃疸齣血型賴株LPS閤成、裝配途徑與典型的革蘭陰性菌,如大腸埃希菌K-12相似,主要差異在于鉤體特殊的脂肪痠代謝途徑和O-抗原多糖結構.該研究為進一步探討鉤體LPS基因功能及其與緻病性關繫奠定基礎.
목적예측문호구체황달출혈형뢰주지다당(LPS)합성、장배도경,병대기중궤개관건기인적특정진행심입분석.방법사용NCBI/BlastX,ProDom/Blast,Jpred2,TMHMM대문호구체황달출혈형뢰주전기인조ORF기인소편마단백진행재선분석,병사용Bioedit,Pep Tool연건진행단백질일、이급결구분석.결과학정료지질A화핵심다당생물합성기인lpxA、lpxB、lpxC、lpxD、lpxK、kdsA、kdsB、kdtA、lnt、htrB화O-항원생물합성기인족rfb locus 등이급장배、과막전운중적기인rfbP、rfbX、rfc、rfaL、rfe회제료LPS합성급장배도경시의도.병대합성화장배도경중궤개관건적기인편마단백(LpxA、 Rfc、 RfbX、 RfaL)적이급결구、과막구역、결구역등진행료분석.결론문호구체황달출혈형뢰주LPS합성、장배도경여전형적혁란음성균,여대장애희균K-12상사,주요차이재우구체특수적지방산대사도경화O-항원다당결구.해연구위진일보탐토구체LPS기인공능급기여치병성관계전정기출.
