免疫学杂志
免疫學雜誌
면역학잡지
IMMUNOLOGICAL JOURNAL
2006年
1期
17-19
,共3页
闫红%徐发良%顾长国%胡承香%葛衡江%李磊
閆紅%徐髮良%顧長國%鬍承香%葛衡江%李磊
염홍%서발량%고장국%호승향%갈형강%리뢰
生物信息学%MD-2%抗原%表位
生物信息學%MD-2%抗原%錶位
생물신식학%MD-2%항원%표위
目的利用生物信息学预测髓样分化蛋白-2(myeloid differentiation protein-2,MD-2)的B细胞抗原表位,为MD-2特异性抗体的制备提供实验基础.方法采用多种生物软件和互联网服务器,以单参数(亲水性、抗原性、可及性及可塑性)预测为基础,二级结构预测初步筛选,抗原指数最终确定的方法预测MD-2的B细胞抗原表位.结果96～110序列(RGSDDDYSFCRALK)的亲水性和抗原指数(AI=0.043)显著高于其他候选片断;65～76序列(YIPRRDLKQLYF)和107～117序列(ALKGETVNTTI)的AI分别为0.0063和0.0036.结论96～110序列(RGSDDDYSFCRALK)是MD-2的B细胞优势抗原表位.
目的利用生物信息學預測髓樣分化蛋白-2(myeloid differentiation protein-2,MD-2)的B細胞抗原錶位,為MD-2特異性抗體的製備提供實驗基礎.方法採用多種生物軟件和互聯網服務器,以單參數(親水性、抗原性、可及性及可塑性)預測為基礎,二級結構預測初步篩選,抗原指數最終確定的方法預測MD-2的B細胞抗原錶位.結果96～110序列(RGSDDDYSFCRALK)的親水性和抗原指數(AI=0.043)顯著高于其他候選片斷;65～76序列(YIPRRDLKQLYF)和107～117序列(ALKGETVNTTI)的AI分彆為0.0063和0.0036.結論96～110序列(RGSDDDYSFCRALK)是MD-2的B細胞優勢抗原錶位.
목적이용생물신식학예측수양분화단백-2(myeloid differentiation protein-2,MD-2)적B세포항원표위,위MD-2특이성항체적제비제공실험기출.방법채용다충생물연건화호련망복무기,이단삼수(친수성、항원성、가급성급가소성)예측위기출,이급결구예측초보사선,항원지수최종학정적방법예측MD-2적B세포항원표위.결과96～110서렬(RGSDDDYSFCRALK)적친수성화항원지수(AI=0.043)현저고우기타후선편단;65～76서렬(YIPRRDLKQLYF)화107～117서렬(ALKGETVNTTI)적AI분별위0.0063화0.0036.결론96～110서렬(RGSDDDYSFCRALK)시MD-2적B세포우세항원표위.
