棉花学报
棉花學報
면화학보
COTTON SCIENCE
2011年
6期
490-499
,共10页
简桂良%赵磊%张文蔚%齐放军%王升正
簡桂良%趙磊%張文蔚%齊放軍%王升正
간계량%조뢰%장문위%제방군%왕승정
棉花%抗病基因同源序列(RGA)%核苷酸结合位点似BS)%生物信息学分析%多态性
棉花%抗病基因同源序列(RGA)%覈苷痠結閤位點似BS)%生物信息學分析%多態性
면화%항병기인동원서렬(RGA)%핵감산결합위점사BS)%생물신식학분석%다태성
根据已知抗病基因NBS(Nucleotide-binding sites)保守区的P-loop和GLPL区设计一对简并引物F1/R1,以已鉴定黄萎病抗性的9个陆地棉品种基因组DNA为模板进行PCR扩增.在9个品种中均扩增出500bp左右的条带.对目的条带进行回收,连接、转化克隆得到350个阳性克隆,进行测序.在8个棉花品种中克隆到74条具有完整开放读码框的棉花RGAs序列.这74条序列共有64种不同的基因型,有10条与其它品种中的RGAs序列相同.用MEGA软件对8个棉花品种的74条RGA序列以及12个已知的抗病基因的NBS区域进行聚类分析,结果分为TIR和nonTIR两大类,而nonTIR类又细分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ 3类.4类RGAs之间的氨基酸序列相似性较低,而各大类之内来自不同品种的RGAs的相似度却非常高.推测各大类中相似性非常高的这部分序列分别属于同一个基因家族,从位点上说可能处于同一个基因簇.
根據已知抗病基因NBS(Nucleotide-binding sites)保守區的P-loop和GLPL區設計一對簡併引物F1/R1,以已鑒定黃萎病抗性的9箇陸地棉品種基因組DNA為模闆進行PCR擴增.在9箇品種中均擴增齣500bp左右的條帶.對目的條帶進行迴收,連接、轉化剋隆得到350箇暘性剋隆,進行測序.在8箇棉花品種中剋隆到74條具有完整開放讀碼框的棉花RGAs序列.這74條序列共有64種不同的基因型,有10條與其它品種中的RGAs序列相同.用MEGA軟件對8箇棉花品種的74條RGA序列以及12箇已知的抗病基因的NBS區域進行聚類分析,結果分為TIR和nonTIR兩大類,而nonTIR類又細分為Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ 3類.4類RGAs之間的氨基痠序列相似性較低,而各大類之內來自不同品種的RGAs的相似度卻非常高.推測各大類中相似性非常高的這部分序列分彆屬于同一箇基因傢族,從位點上說可能處于同一箇基因簇.
근거이지항병기인NBS(Nucleotide-binding sites)보수구적P-loop화GLPL구설계일대간병인물F1/R1,이이감정황위병항성적9개륙지면품충기인조DNA위모판진행PCR확증.재9개품충중균확증출500bp좌우적조대.대목적조대진행회수,련접、전화극륭득도350개양성극륭,진행측서.재8개면화품충중극륭도74조구유완정개방독마광적면화RGAs서렬.저74조서렬공유64충불동적기인형,유10조여기타품충중적RGAs서렬상동.용MEGA연건대8개면화품충적74조RGA서렬이급12개이지적항병기인적NBS구역진행취류분석,결과분위TIR화nonTIR량대류,이nonTIR류우세분위Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ 3류.4류RGAs지간적안기산서렬상사성교저,이각대류지내래자불동품충적RGAs적상사도각비상고.추측각대류중상사성비상고적저부분서렬분별속우동일개기인가족,종위점상설가능처우동일개기인족.
