生物化学与生物物理进展
生物化學與生物物理進展
생물화학여생물물리진전
PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS
2007年
8期
791-799
,共9页
蛋白质组学%de novo测序%数据库搜索%新蛋白质鉴定
蛋白質組學%de novo測序%數據庫搜索%新蛋白質鑒定
단백질조학%de novo측서%수거고수색%신단백질감정
当前,基于生物质谱进行蛋白质鉴定的技术已经成为蛋白质组学研究的支撑技术之一.产生的数据主要使用数据库搜索的方法进行处理,这种方法的一大缺陷是不能鉴定数据库中未包含的蛋白质,因此如何充分利用质谱数据对蛋白质组研究的意义很大,而新蛋白质鉴定更是其中一个重要的内容.新蛋白质鉴定是蛋白质鉴定的一个方面,新蛋白质的定义按照序列和功能的已知程度分为3个层次;以蛋白质鉴定的方法为基础,目前新蛋白质鉴定的方法可分为de novo测序和相似序列搜索结合的方法以及搜索EST、基因组等核酸数据库的方法2大类;两者各有利弊.存在各自的问题和相应处理的策略.不同的研究者可以根据具体目的应用和发展不同的鉴定方法,同时新蛋白质的鉴定也将随着蛋白质组学研究的发展而更加完善.
噹前,基于生物質譜進行蛋白質鑒定的技術已經成為蛋白質組學研究的支撐技術之一.產生的數據主要使用數據庫搜索的方法進行處理,這種方法的一大缺陷是不能鑒定數據庫中未包含的蛋白質,因此如何充分利用質譜數據對蛋白質組研究的意義很大,而新蛋白質鑒定更是其中一箇重要的內容.新蛋白質鑒定是蛋白質鑒定的一箇方麵,新蛋白質的定義按照序列和功能的已知程度分為3箇層次;以蛋白質鑒定的方法為基礎,目前新蛋白質鑒定的方法可分為de novo測序和相似序列搜索結閤的方法以及搜索EST、基因組等覈痠數據庫的方法2大類;兩者各有利弊.存在各自的問題和相應處理的策略.不同的研究者可以根據具體目的應用和髮展不同的鑒定方法,同時新蛋白質的鑒定也將隨著蛋白質組學研究的髮展而更加完善.
당전,기우생물질보진행단백질감정적기술이경성위단백질조학연구적지탱기술지일.산생적수거주요사용수거고수색적방법진행처리,저충방법적일대결함시불능감정수거고중미포함적단백질,인차여하충분이용질보수거대단백질조연구적의의흔대,이신단백질감정경시기중일개중요적내용.신단백질감정시단백질감정적일개방면,신단백질적정의안조서렬화공능적이지정도분위3개층차;이단백질감정적방법위기출,목전신단백질감정적방법가분위de novo측서화상사서렬수색결합적방법이급수색EST、기인조등핵산수거고적방법2대류;량자각유리폐.존재각자적문제화상응처리적책략.불동적연구자가이근거구체목적응용화발전불동적감정방법,동시신단백질적감정야장수착단백질조학연구적발전이경가완선.
