蚕业科学
蠶業科學
잠업과학
ACTA SERICOLOGICA SINICA
2006年
2期
199-205
,共7页
王崇龙%薛仁宇%曹广力%沈卫德%贡成良
王崇龍%薛仁宇%曹廣力%瀋衛德%貢成良
왕숭룡%설인우%조엄력%침위덕%공성량
杆状病毒%家蚕核型多角体病毒%碱性磷酸酶基因%序列分析%共进化
桿狀病毒%傢蠶覈型多角體病毒%堿性燐痠酶基因%序列分析%共進化
간상병독%가잠핵형다각체병독%감성린산매기인%서렬분석%공진화
基于为杆状病毒分类提供新的依据,克隆了家蚕核型多角体病毒苏州株(BmNPV-SU)碱性核酸酶基因(alk-exo)及其侧翼区,并进行序列和进化分析.BLAST检索显示,BmNPV-SU alk-exo 上游的部分ORF109序列仅在AcNPV、RoNPV中检索到同源序列;下游区域在AcNPV、RoNPV、SlNPV的基因组中检索到同源序列.序列分析表明,BmNPV-SU的alk-exo基因编码420个氨基酸残基,下游区域存在2个正向的重复.比对结果分析显示,在22种杆状病毒中,alk-exo基因间核苷酸序列和氨基酸序列的同源性不高,变异较大.同时,利用MEGA软件包中的UMEGA算法建立了基于alk-exo基因的分子进化系统树,表明通过杆状病毒的进化可以反映宿主昆虫的进化,杆状病毒与其宿主昆虫之间存在共进化关系.
基于為桿狀病毒分類提供新的依據,剋隆瞭傢蠶覈型多角體病毒囌州株(BmNPV-SU)堿性覈痠酶基因(alk-exo)及其側翼區,併進行序列和進化分析.BLAST檢索顯示,BmNPV-SU alk-exo 上遊的部分ORF109序列僅在AcNPV、RoNPV中檢索到同源序列;下遊區域在AcNPV、RoNPV、SlNPV的基因組中檢索到同源序列.序列分析錶明,BmNPV-SU的alk-exo基因編碼420箇氨基痠殘基,下遊區域存在2箇正嚮的重複.比對結果分析顯示,在22種桿狀病毒中,alk-exo基因間覈苷痠序列和氨基痠序列的同源性不高,變異較大.同時,利用MEGA軟件包中的UMEGA算法建立瞭基于alk-exo基因的分子進化繫統樹,錶明通過桿狀病毒的進化可以反映宿主昆蟲的進化,桿狀病毒與其宿主昆蟲之間存在共進化關繫.
기우위간상병독분류제공신적의거,극륭료가잠핵형다각체병독소주주(BmNPV-SU)감성핵산매기인(alk-exo)급기측익구,병진행서렬화진화분석.BLAST검색현시,BmNPV-SU alk-exo 상유적부분ORF109서렬부재AcNPV、RoNPV중검색도동원서렬;하유구역재AcNPV、RoNPV、SlNPV적기인조중검색도동원서렬.서렬분석표명,BmNPV-SU적alk-exo기인편마420개안기산잔기,하유구역존재2개정향적중복.비대결과분석현시,재22충간상병독중,alk-exo기인간핵감산서렬화안기산서렬적동원성불고,변이교대.동시,이용MEGA연건포중적UMEGA산법건립료기우alk-exo기인적분자진화계통수,표명통과간상병독적진화가이반영숙주곤충적진화,간상병독여기숙주곤충지간존재공진화관계.
