山东农业大学学报（自然科学版）
山東農業大學學報（自然科學版）
산동농업대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF SHANDONG AGRICULTURAL UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE)
2010年
2期
164-168,174
,共6页
吴炳江%阎鹏磊%刘东篱%郑成超%杨国栋
吳炳江%閻鵬磊%劉東籬%鄭成超%楊國棟
오병강%염붕뢰%류동리%정성초%양국동
拟南芥%全基因组芯片%盐胁迫响应启动子
擬南芥%全基因組芯片%鹽脅迫響應啟動子
의남개%전기인조심편%염협박향응계동자
本研究使用生物信息学方法分析了拟南芥盐胁迫响应的顺式作用元件.首先分析盐胁迫0.5 h、1 h的拟南芥全基因组芯片,得到627个盐胁迫上调基因和282个下调基因.然后使用MEME软件分析了盐胁迫响应基因的启动子,得到10个保守元件.通过显著性分布分析表明Motif_1\Motif_8\Motif_10显著分布于上调基因启动子中;Motif_1\Motif_10显著不分布于盐胁迫下调基因启动子中.Motif_1元件是G-box元件(ABRE(ABA Responsive Element)元件),大量分布于盐胁迫上调基因启动子中,广泛参与盐胁迫过程中ABA依赖的信号转导途径.Motif_8、Motif_10分别类似于ABRE元件和DRE(Dehydration-Responsive Element)元件,但由于和ABRE、DRE元件的保守序列不尽相同,Motif_8\Motif_10很有可能是新的盐胁迫响应元件.本研究对于研究拟南芥在盐胁迫应答过程中在转录水平上发生的调控过程具有重要帮助作用.
本研究使用生物信息學方法分析瞭擬南芥鹽脅迫響應的順式作用元件.首先分析鹽脅迫0.5 h、1 h的擬南芥全基因組芯片,得到627箇鹽脅迫上調基因和282箇下調基因.然後使用MEME軟件分析瞭鹽脅迫響應基因的啟動子,得到10箇保守元件.通過顯著性分佈分析錶明Motif_1\Motif_8\Motif_10顯著分佈于上調基因啟動子中;Motif_1\Motif_10顯著不分佈于鹽脅迫下調基因啟動子中.Motif_1元件是G-box元件(ABRE(ABA Responsive Element)元件),大量分佈于鹽脅迫上調基因啟動子中,廣汎參與鹽脅迫過程中ABA依賴的信號轉導途徑.Motif_8、Motif_10分彆類似于ABRE元件和DRE(Dehydration-Responsive Element)元件,但由于和ABRE、DRE元件的保守序列不儘相同,Motif_8\Motif_10很有可能是新的鹽脅迫響應元件.本研究對于研究擬南芥在鹽脅迫應答過程中在轉錄水平上髮生的調控過程具有重要幫助作用.
본연구사용생물신식학방법분석료의남개염협박향응적순식작용원건.수선분석염협박0.5 h、1 h적의남개전기인조심편,득도627개염협박상조기인화282개하조기인.연후사용MEME연건분석료염협박향응기인적계동자,득도10개보수원건.통과현저성분포분석표명Motif_1\Motif_8\Motif_10현저분포우상조기인계동자중;Motif_1\Motif_10현저불분포우염협박하조기인계동자중.Motif_1원건시G-box원건(ABRE(ABA Responsive Element)원건),대량분포우염협박상조기인계동자중,엄범삼여염협박과정중ABA의뢰적신호전도도경.Motif_8、Motif_10분별유사우ABRE원건화DRE(Dehydration-Responsive Element)원건,단유우화ABRE、DRE원건적보수서렬불진상동,Motif_8\Motif_10흔유가능시신적염협박향응원건.본연구대우연구의남개재염협박응답과정중재전록수평상발생적조공과정구유중요방조작용.
