生物技术通报
生物技術通報
생물기술통보
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2012年
6期
111-115
,共5页
果胶甲基酯酶%香蕉枯萎病%香蕉枯萎病菌%生物信息学分析
果膠甲基酯酶%香蕉枯萎病%香蕉枯萎病菌%生物信息學分析
과효갑기지매%향초고위병%향초고위병균%생물신식학분석
旨在了解香蕉枯萎病菌(Fusarium oxysporum f.sp.cubense)4号生理小种(FOC4) PME基因序列特征,根据同源物种PME相关序列设计引物,利用PCR和RT-PCR技术,克隆FOC4序列基因和开放阅读框,命名为Foc4Pme.结果表明,所获得的PME基因均含有2个内舍子和3个外显子,990 bp的片段,编码329个氨基酸.预测编码蛋白有信号肽,具有1个功能位点,其分子质量和等电点分为34.894 8 kD和9.17,该蛋白为稳定存在的蛋白.该蛋白疏水性最大值为2.022,最小值为-2.156,大部分区域为亲水区.该基因编码的蛋白具有一定保守性,进化上与镰刀菌亲缘关系最近.
旨在瞭解香蕉枯萎病菌(Fusarium oxysporum f.sp.cubense)4號生理小種(FOC4) PME基因序列特徵,根據同源物種PME相關序列設計引物,利用PCR和RT-PCR技術,剋隆FOC4序列基因和開放閱讀框,命名為Foc4Pme.結果錶明,所穫得的PME基因均含有2箇內捨子和3箇外顯子,990 bp的片段,編碼329箇氨基痠.預測編碼蛋白有信號肽,具有1箇功能位點,其分子質量和等電點分為34.894 8 kD和9.17,該蛋白為穩定存在的蛋白.該蛋白疏水性最大值為2.022,最小值為-2.156,大部分區域為親水區.該基因編碼的蛋白具有一定保守性,進化上與鐮刀菌親緣關繫最近.
지재료해향초고위병균(Fusarium oxysporum f.sp.cubense)4호생리소충(FOC4) PME기인서렬특정,근거동원물충PME상관서렬설계인물,이용PCR화RT-PCR기술,극륭FOC4서렬기인화개방열독광,명명위Foc4Pme.결과표명,소획득적PME기인균함유2개내사자화3개외현자,990 bp적편단,편마329개안기산.예측편마단백유신호태,구유1개공능위점,기분자질량화등전점분위34.894 8 kD화9.17,해단백위은정존재적단백.해단백소수성최대치위2.022,최소치위-2.156,대부분구역위친수구.해기인편마적단백구유일정보수성,진화상여렴도균친연관계최근.