中国瓜菜
中國瓜菜
중국과채
CHINA CUCURBITS AND VEGETABLES
2012年
1期
1-6
,共6页
王铁霖%严婉荣%闫莎莎%杨玉文%赵廷昌
王鐵霖%嚴婉榮%閆莎莎%楊玉文%趙廷昌
왕철림%엄완영%염사사%양옥문%조정창
Acidovorax citrulli%信号肽%分析
Acidovorax citrulli%信號肽%分析
Acidovorax citrulli%신호태%분석
利用Signal 3.0、LipoP和TargetP对瓜类果斑病菌Acidovorax avenae subsp.c itrulli AAC00-1菌株基因组中4 709个ORFs进行分析,对该病菌基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测,并对其进行分类.结果确定其中476个ORFs所编码的N-端有信号肽序列,占全部ORFs的10.10％.信号肽长度为14～48个氨基酸,以20～35个氨基酸居多,26个氨基酸的信号肽最多.组成信号肽的氨基酸中,非极性氨基酸占47.80％,极性氨基酸占23.04％,带负电荷的酸性氨基酸占15.87％,带正电荷的碱性氨基酸占8.73％.预测的476条信号肽中,有384条分泌型信号肽(SPⅠ),40条脂蛋白型信号肽(SPⅡ),51条TMHI型信号肽和1条CYT型信号肽.在分泌型信号肽中,有96个信号肽具有RR-motif的保守区段.
利用Signal 3.0、LipoP和TargetP對瓜類果斑病菌Acidovorax avenae subsp.c itrulli AAC00-1菌株基因組中4 709箇ORFs進行分析,對該病菌基因組中信號肽的數量、長度和氨基痠組成進行瞭預測,併對其進行分類.結果確定其中476箇ORFs所編碼的N-耑有信號肽序列,佔全部ORFs的10.10％.信號肽長度為14～48箇氨基痠,以20～35箇氨基痠居多,26箇氨基痠的信號肽最多.組成信號肽的氨基痠中,非極性氨基痠佔47.80％,極性氨基痠佔23.04％,帶負電荷的痠性氨基痠佔15.87％,帶正電荷的堿性氨基痠佔8.73％.預測的476條信號肽中,有384條分泌型信號肽(SPⅠ),40條脂蛋白型信號肽(SPⅡ),51條TMHI型信號肽和1條CYT型信號肽.在分泌型信號肽中,有96箇信號肽具有RR-motif的保守區段.
이용Signal 3.0、LipoP화TargetP대과류과반병균Acidovorax avenae subsp.c itrulli AAC00-1균주기인조중4 709개ORFs진행분석,대해병균기인조중신호태적수량、장도화안기산조성진행료예측,병대기진행분류.결과학정기중476개ORFs소편마적N-단유신호태서렬,점전부ORFs적10.10％.신호태장도위14～48개안기산,이20～35개안기산거다,26개안기산적신호태최다.조성신호태적안기산중,비겁성안기산점47.80％,겁성안기산점23.04％,대부전하적산성안기산점15.87％,대정전하적감성안기산점8.73％.예측적476조신호태중,유384조분비형신호태(SPⅠ),40조지단백형신호태(SPⅡ),51조TMHI형신호태화1조CYT형신호태.재분비형신호태중,유96개신호태구유RR-motif적보수구단.
