微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2007年
2期
370-373
,共4页
林朝洪%倪学勤%曾东%周小秋
林朝洪%倪學勤%曾東%週小鞦
림조홍%예학근%증동%주소추
重复序列%ERIC(IRU)%ERIC-PCR%动物肠道菌群
重複序列%ERIC(IRU)%ERIC-PCR%動物腸道菌群
중복서렬%ERIC(IRU)%ERIC-PCR%동물장도균군
重复序列几乎存在于所有生物的基因组中."肠道细菌基因间重复序列"(Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus, ERIC)是主要存在于肠道细菌的一类基因间重复序列,也称为"基因间重复单位"(Intergenic Repetitive Unit, IRU).ERIC(IRU)首先在大肠杆菌 (Escherichia coli)中发现,后来又在多种其他细菌中发现.ERIC(IRU)长127bp,有的还有插入序列.绝大多数ERIC(IRU)都可以转录,mRNA形成茎环结构.ERIC(IRU)局限于基因组可转录区,即多顺反子操纵子基因间区域,或开放阅读框架上、下游非翻译区.ERIC(IRU)很可能调节侧翼基因(flanking gene)的表达.ERIC(IRU)高度保守,可能其变异受到自然选择压力的限制或它本身就可能是"自私的DNA"(selfish DNA).Versalovic等建立起ERIC-PCR,它可以有效地同时平行分析不同生态系统的结构差异以及动态监测同一生态系统微生物群落结构的变化.近年来这一技术逐渐运用到对动物肠道菌群的研究上.
重複序列幾乎存在于所有生物的基因組中."腸道細菌基因間重複序列"(Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus, ERIC)是主要存在于腸道細菌的一類基因間重複序列,也稱為"基因間重複單位"(Intergenic Repetitive Unit, IRU).ERIC(IRU)首先在大腸桿菌 (Escherichia coli)中髮現,後來又在多種其他細菌中髮現.ERIC(IRU)長127bp,有的還有插入序列.絕大多數ERIC(IRU)都可以轉錄,mRNA形成莖環結構.ERIC(IRU)跼限于基因組可轉錄區,即多順反子操縱子基因間區域,或開放閱讀框架上、下遊非翻譯區.ERIC(IRU)很可能調節側翼基因(flanking gene)的錶達.ERIC(IRU)高度保守,可能其變異受到自然選擇壓力的限製或它本身就可能是"自私的DNA"(selfish DNA).Versalovic等建立起ERIC-PCR,它可以有效地同時平行分析不同生態繫統的結構差異以及動態鑑測同一生態繫統微生物群落結構的變化.近年來這一技術逐漸運用到對動物腸道菌群的研究上.
중복서렬궤호존재우소유생물적기인조중."장도세균기인간중복서렬"(Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus, ERIC)시주요존재우장도세균적일류기인간중복서렬,야칭위"기인간중복단위"(Intergenic Repetitive Unit, IRU).ERIC(IRU)수선재대장간균 (Escherichia coli)중발현,후래우재다충기타세균중발현.ERIC(IRU)장127bp,유적환유삽입서렬.절대다수ERIC(IRU)도가이전록,mRNA형성경배결구.ERIC(IRU)국한우기인조가전록구,즉다순반자조종자기인간구역,혹개방열독광가상、하유비번역구.ERIC(IRU)흔가능조절측익기인(flanking gene)적표체.ERIC(IRU)고도보수,가능기변이수도자연선택압력적한제혹타본신취가능시"자사적DNA"(selfish DNA).Versalovic등건립기ERIC-PCR,타가이유효지동시평행분석불동생태계통적결구차이이급동태감측동일생태계통미생물군락결구적변화.근년래저일기술축점운용도대동물장도균군적연구상.