中国海洋大学学报(自然科学版)
中國海洋大學學報(自然科學版)
중국해양대학학보(자연과학판)
PERIODICAL OF OCEAN UNIVERSITY OF CHINA
2008年
5期
733-738
,共6页
缢蛏%微卫星%磁珠富集%PCR
縊蟶%微衛星%磁珠富集%PCR
액정%미위성%자주부집%PCR
分析了缢蛏(Sinonovacula constricta)基因组文库中微卫星序列的特性及微卫星引物的遗传特征.采用磁珠富集珐和PCR 筛选法,以CA15为探针,快速分离含有微卫星序列的阳性克隆.结果表明,在筛选的210个白色菌落中,得到58个微卫星序列,阳性克隆率为27.6%,核心重复序列为两碱基和三碱基的微卫星居多,其中完美型占39.7%,非完美型39.7%,复合型占10.3%,非完美型与复合型共存的占10.3%.微卫星重复次数主要集中在20~40次之间,占66%,最高为63次.除探针中使用的CA重复单元外,还观察到AG/TC,AT/TA,AAC/TTG,CAA/GTT,TGA,AAT,AGAA,GTTT/CAAA,AAAT/TTTA,TTTC,CCTA,TCTA,TCCC,TGCC,GTTTCT,CTGTT,CACACC,TATACA,TTTTG的重复序列.利用Primer Premier5.0设计引物24对,经过初步筛选得到适合的微卫星引物18对,为今后未知微卫星标记的开发,群体遗传结构的分析,优良品种的选育提供基础.
分析瞭縊蟶(Sinonovacula constricta)基因組文庫中微衛星序列的特性及微衛星引物的遺傳特徵.採用磁珠富集琺和PCR 篩選法,以CA15為探針,快速分離含有微衛星序列的暘性剋隆.結果錶明,在篩選的210箇白色菌落中,得到58箇微衛星序列,暘性剋隆率為27.6%,覈心重複序列為兩堿基和三堿基的微衛星居多,其中完美型佔39.7%,非完美型39.7%,複閤型佔10.3%,非完美型與複閤型共存的佔10.3%.微衛星重複次數主要集中在20~40次之間,佔66%,最高為63次.除探針中使用的CA重複單元外,還觀察到AG/TC,AT/TA,AAC/TTG,CAA/GTT,TGA,AAT,AGAA,GTTT/CAAA,AAAT/TTTA,TTTC,CCTA,TCTA,TCCC,TGCC,GTTTCT,CTGTT,CACACC,TATACA,TTTTG的重複序列.利用Primer Premier5.0設計引物24對,經過初步篩選得到適閤的微衛星引物18對,為今後未知微衛星標記的開髮,群體遺傳結構的分析,優良品種的選育提供基礎.
분석료액정(Sinonovacula constricta)기인조문고중미위성서렬적특성급미위성인물적유전특정.채용자주부집법화PCR 사선법,이CA15위탐침,쾌속분리함유미위성서렬적양성극륭.결과표명,재사선적210개백색균락중,득도58개미위성서렬,양성극륭솔위27.6%,핵심중복서렬위량감기화삼감기적미위성거다,기중완미형점39.7%,비완미형39.7%,복합형점10.3%,비완미형여복합형공존적점10.3%.미위성중복차수주요집중재20~40차지간,점66%,최고위63차.제탐침중사용적CA중복단원외,환관찰도AG/TC,AT/TA,AAC/TTG,CAA/GTT,TGA,AAT,AGAA,GTTT/CAAA,AAAT/TTTA,TTTC,CCTA,TCTA,TCCC,TGCC,GTTTCT,CTGTT,CACACC,TATACA,TTTTG적중복서렬.이용Primer Premier5.0설계인물24대,경과초보사선득도괄합적미위성인물18대,위금후미지미위성표기적개발,군체유전결구적분석,우량품충적선육제공기출.