实用预防医学
實用預防醫學
실용예방의학
PRACTICAL PREVENTIVE MEDICINE
2011年
3期
420-424
,共5页
欧新华%张如胜%叶文%宋克云%孙边成%陈法明
歐新華%張如勝%葉文%宋剋雲%孫邊成%陳法明
구신화%장여성%협문%송극운%손변성%진법명
手足口病%肠道病毒71型%VP1%序列分析
手足口病%腸道病毒71型%VP1%序列分析
수족구병%장도병독71형%VP1%서렬분석
目的 了解2010年长沙市手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)重症和普通病例肠道病毒71型(hu-man Enterovirus 71,EV71)VP1区基因特征.方法 收集12例HFMD重症和普通病例的咽拭子或肛拭子标本进行VP1区基因RT-PCR扩增和核苷酸序列测定,测序结果利用sequin软件提交至GenBank,Lasergene和Mega5软件对测序结果进行氨基酸比对分析和构建进化树.结果 12株EV71 VP1区基因序列在进化树上与C基因型中的C4<'a>亚型代表株属同一分支,在核苷酸同源性分析中,12株EV71与C4<'a>亚型代表株(3254-TAI-98)的同源性达到92.6%~93.3%,高于与A、B、C1、C2、C3、CVA16型或亚型代表株的同源性(分别为79.9%~80.7%、83.1%~84.0%、87.9%~88.7%、89.1%~89.8%、87.8%~88.2%和57.3%~58.4%);12株EV71病毒VP1之间的核苷酸有高度的同源性:同源性为98.1%~100.0%,高于与C4亚型代表株的同源性(92.6%~93.3%和91.8%~92.7%).2010年分离自长沙的重症和普通病例与2008年分离自北京、深圳和阜阳的EV71病毒VP1基因序列之间的氨基酸变异位点少.结论 2010年长沙市流行的EV71型病毒属于C基因型中的C4亚型;12例HFMD重症和普通病例的EV71 VP1区基因序列差异较小;不同时间、不同地区和不同病例来源的EV71 VP1区氨基酸变异位点无关联.
目的 瞭解2010年長沙市手足口病(hand-foot-mouth disease,HFMD)重癥和普通病例腸道病毒71型(hu-man Enterovirus 71,EV71)VP1區基因特徵.方法 收集12例HFMD重癥和普通病例的嚥拭子或肛拭子標本進行VP1區基因RT-PCR擴增和覈苷痠序列測定,測序結果利用sequin軟件提交至GenBank,Lasergene和Mega5軟件對測序結果進行氨基痠比對分析和構建進化樹.結果 12株EV71 VP1區基因序列在進化樹上與C基因型中的C4<'a>亞型代錶株屬同一分支,在覈苷痠同源性分析中,12株EV71與C4<'a>亞型代錶株(3254-TAI-98)的同源性達到92.6%~93.3%,高于與A、B、C1、C2、C3、CVA16型或亞型代錶株的同源性(分彆為79.9%~80.7%、83.1%~84.0%、87.9%~88.7%、89.1%~89.8%、87.8%~88.2%和57.3%~58.4%);12株EV71病毒VP1之間的覈苷痠有高度的同源性:同源性為98.1%~100.0%,高于與C4亞型代錶株的同源性(92.6%~93.3%和91.8%~92.7%).2010年分離自長沙的重癥和普通病例與2008年分離自北京、深圳和阜暘的EV71病毒VP1基因序列之間的氨基痠變異位點少.結論 2010年長沙市流行的EV71型病毒屬于C基因型中的C4亞型;12例HFMD重癥和普通病例的EV71 VP1區基因序列差異較小;不同時間、不同地區和不同病例來源的EV71 VP1區氨基痠變異位點無關聯.
목적 료해2010년장사시수족구병(hand-foot-mouth disease,HFMD)중증화보통병례장도병독71형(hu-man Enterovirus 71,EV71)VP1구기인특정.방법 수집12례HFMD중증화보통병례적인식자혹항식자표본진행VP1구기인RT-PCR확증화핵감산서렬측정,측서결과이용sequin연건제교지GenBank,Lasergene화Mega5연건대측서결과진행안기산비대분석화구건진화수.결과 12주EV71 VP1구기인서렬재진화수상여C기인형중적C4<'a>아형대표주속동일분지,재핵감산동원성분석중,12주EV71여C4<'a>아형대표주(3254-TAI-98)적동원성체도92.6%~93.3%,고우여A、B、C1、C2、C3、CVA16형혹아형대표주적동원성(분별위79.9%~80.7%、83.1%~84.0%、87.9%~88.7%、89.1%~89.8%、87.8%~88.2%화57.3%~58.4%);12주EV71병독VP1지간적핵감산유고도적동원성:동원성위98.1%~100.0%,고우여C4아형대표주적동원성(92.6%~93.3%화91.8%~92.7%).2010년분리자장사적중증화보통병례여2008년분리자북경、심수화부양적EV71병독VP1기인서렬지간적안기산변이위점소.결론 2010년장사시류행적EV71형병독속우C기인형중적C4아형;12례HFMD중증화보통병례적EV71 VP1구기인서렬차이교소;불동시간、불동지구화불동병례래원적EV71 VP1구안기산변이위점무관련.