中国人兽共患病杂志
中國人獸共患病雜誌
중국인수공환병잡지
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2001年
4期
6-9
,共4页
王鹏程%秦鄂德%耿丽卿%于曼%赵卫%陈水平%苑锡同
王鵬程%秦鄂德%耿麗卿%于曼%趙衛%陳水平%苑錫同
왕붕정%진악덕%경려경%우만%조위%진수평%원석동
登革4型病毒%基因组非编码区%序列测定与分析
登革4型病毒%基因組非編碼區%序列測定與分析
등혁4형병독%기인조비편마구%서렬측정여분석
目的测定和分析我国登革4型病毒广州(D4-B5)株基因组非编码区(NCR)序列,为探讨其结构特征与功能的关系提供依据.方法从登革4型病毒感染的乳鼠脑中提取总RNA,采用RACE法扩增病毒基因组5'和3'端片段,分别将其克隆至pGEM-T载体,挑取阳性克隆进行序列测定;利用RNAdraw软件对非编码区二级结构进行预测.结果与结论我国登革4型病毒广州株基因组5＇和3＇非编码区长度分别为101 nt和403 nt,具有黄病毒共有的保守序列和二级结构.与登革4型病毒多米尼加分离株比较显示,5＇NCR第57和36位核苷酸的改变对其二级结构有显著的影响;3＇NCR多处核苷酸差异导致两者预测的二级结构差别较大,但均能形成相同的保守结构,它们可能对病毒基因组RNA的复制、组装起重要作用.
目的測定和分析我國登革4型病毒廣州(D4-B5)株基因組非編碼區(NCR)序列,為探討其結構特徵與功能的關繫提供依據.方法從登革4型病毒感染的乳鼠腦中提取總RNA,採用RACE法擴增病毒基因組5'和3'耑片段,分彆將其剋隆至pGEM-T載體,挑取暘性剋隆進行序列測定;利用RNAdraw軟件對非編碼區二級結構進行預測.結果與結論我國登革4型病毒廣州株基因組5＇和3＇非編碼區長度分彆為101 nt和403 nt,具有黃病毒共有的保守序列和二級結構.與登革4型病毒多米尼加分離株比較顯示,5＇NCR第57和36位覈苷痠的改變對其二級結構有顯著的影響;3＇NCR多處覈苷痠差異導緻兩者預測的二級結構差彆較大,但均能形成相同的保守結構,它們可能對病毒基因組RNA的複製、組裝起重要作用.
목적측정화분석아국등혁4형병독엄주(D4-B5)주기인조비편마구(NCR)서렬,위탐토기결구특정여공능적관계제공의거.방법종등혁4형병독감염적유서뇌중제취총RNA,채용RACE법확증병독기인조5'화3'단편단,분별장기극륭지pGEM-T재체,도취양성극륭진행서렬측정;이용RNAdraw연건대비편마구이급결구진행예측.결과여결론아국등혁4형병독엄주주기인조5＇화3＇비편마구장도분별위101 nt화403 nt,구유황병독공유적보수서렬화이급결구.여등혁4형병독다미니가분리주비교현시,5＇NCR제57화36위핵감산적개변대기이급결구유현저적영향;3＇NCR다처핵감산차이도치량자예측적이급결구차별교대,단균능형성상동적보수결구,타문가능대병독기인조RNA적복제、조장기중요작용.
