南方农业学报
南方農業學報
남방농업학보
GUANGXI AGRICULTURAL SCIENCES
2012年
6期
855-860
,共6页
于旭蓉%仇雪梅%常亚青%王秀利%刘洋
于旭蓉%仇雪梅%常亞青%王秀利%劉洋
우욱용%구설매%상아청%왕수리%류양
长牡蛎%钙调蛋白%基因克隆%多态性分析%SMART RACE%EPIC-PCR%PCR-SSCP
長牡蠣%鈣調蛋白%基因剋隆%多態性分析%SMART RACE%EPIC-PCR%PCR-SSCP
장모려%개조단백%기인극륭%다태성분석%SMART RACE%EPIC-PCR%PCR-SSCP
[目的]从钙调蛋白(CaM)基因克隆和序列分析入手,对长牡蛎CaM基因的功能进行深入研究,为生产实践提供参考依据.[方法]利用SMART RACE和EPIC-PCR技术克隆长牡蛎CaM基因,然后采用PCR-SSCP技术和DNA测序方法分析长牡蛎CaM基因编码区多态性.[结果]扩增获得长牡蛎CaM基因cDNA全长序列为917 bp,包括开放阅读框(ORF)全长450 bp,编码149个氨基酸；5′非编码区含222 bp,3′非编码区含245 bp; ORF内有3段内含子序列,分别为Intron-1:110 bp、Intron-2:137 bp和Intron-3:143 bp.PCR-SSCP分析获得C5引物野生型TT型、突变型GG型和杂合型GT型3种基因型.基因型和等位基因频率统计结果表明,GG型和G等位基因频率明显高于TT型和T等位基因；而最小二乘分析结果表明,CaM基因位于ORF内第158位T→G的SNPs位点,对长牡蛎的壳重有显著性影响(P＜0.05),但对壳长、壳高、壳宽、体总重及肉重无显著影响.[结论]CaM基因对长牡蛎贝壳形成具有一定的影响作用.
[目的]從鈣調蛋白(CaM)基因剋隆和序列分析入手,對長牡蠣CaM基因的功能進行深入研究,為生產實踐提供參攷依據.[方法]利用SMART RACE和EPIC-PCR技術剋隆長牡蠣CaM基因,然後採用PCR-SSCP技術和DNA測序方法分析長牡蠣CaM基因編碼區多態性.[結果]擴增穫得長牡蠣CaM基因cDNA全長序列為917 bp,包括開放閱讀框(ORF)全長450 bp,編碼149箇氨基痠；5′非編碼區含222 bp,3′非編碼區含245 bp; ORF內有3段內含子序列,分彆為Intron-1:110 bp、Intron-2:137 bp和Intron-3:143 bp.PCR-SSCP分析穫得C5引物野生型TT型、突變型GG型和雜閤型GT型3種基因型.基因型和等位基因頻率統計結果錶明,GG型和G等位基因頻率明顯高于TT型和T等位基因；而最小二乘分析結果錶明,CaM基因位于ORF內第158位T→G的SNPs位點,對長牡蠣的殼重有顯著性影響(P＜0.05),但對殼長、殼高、殼寬、體總重及肉重無顯著影響.[結論]CaM基因對長牡蠣貝殼形成具有一定的影響作用.
[목적]종개조단백(CaM)기인극륭화서렬분석입수,대장모려CaM기인적공능진행심입연구,위생산실천제공삼고의거.[방법]이용SMART RACE화EPIC-PCR기술극륭장모려CaM기인,연후채용PCR-SSCP기술화DNA측서방법분석장모려CaM기인편마구다태성.[결과]확증획득장모려CaM기인cDNA전장서렬위917 bp,포괄개방열독광(ORF)전장450 bp,편마149개안기산；5′비편마구함222 bp,3′비편마구함245 bp; ORF내유3단내함자서렬,분별위Intron-1:110 bp、Intron-2:137 bp화Intron-3:143 bp.PCR-SSCP분석획득C5인물야생형TT형、돌변형GG형화잡합형GT형3충기인형.기인형화등위기인빈솔통계결과표명,GG형화G등위기인빈솔명현고우TT형화T등위기인；이최소이승분석결과표명,CaM기인위우ORF내제158위T→G적SNPs위점,대장모려적각중유현저성영향(P＜0.05),단대각장、각고、각관、체총중급육중무현저영향.[결론]CaM기인대장모려패각형성구유일정적영향작용.
