CAJ | 학술논문

DrIce基因在果蝇的细胞调亡代谢途径中起着重要作用.采用tblastn程序将DrICE在家蚕EST数据库中进行同源性检索,检索到的EST序列进行电子延伸,根据延伸结果设计引物,用RT-PCR检测和克隆测序验证,成功地克隆到家蚕第二种Caspase基因的全长cDNA (GenBank登录号为:AY885228).克隆的cDNA长1 410 bp,ORF长825 bp,编码275个氨基酸残基,预测分子量为31.8 kD,等电点为6.15,基因名定为BmIce.将BmIce的cDNA与家蚕基因组序列进行比对,结果表明该基因具有6个外显子,外显子/内含子边界处均符合GT-AG规则.BmICE在氨基酸水平上与果蝇DrICE、线虫的CED-3的一致性分别为34%和29%,在第169个氨基酸残基处具有QACRG的五肽活性位点,该活性位点是Caspase家族的典型结构.与果蝇Caspase家族聚类分析中,BmICE与果蝇中具有短的N端结构域的DrICE、DCP-1及DECAY聚为一类,根据其结构分析和聚类分析,推测家蚕BmIce基因可能参与细胞凋亡的执行作用.
DrIce기인재과승적세포조망대사도경중기착중요작용.채용tblastn정서장DrICE재가잠EST수거고중진행동원성검색,검색도적EST서렬진행전자연신,근거연신결과설계인물,용RT-PCR검측화극륭측서험증,성공지극륭도가잠제이충Caspase기인적전장cDNA (GenBank등록호위:AY885228).극륭적cDNA장1 410 bp,ORF장825 bp,편마275개안기산잔기,예측분자량위31.8 kD,등전점위6.15,기인명정위BmIce.장BmIce적cDNA여가잠기인조서렬진행비대,결과표명해기인구유6개외현자,외현자/내함자변계처균부합GT-AG규칙.BmICE재안기산수평상여과승DrICE、선충적CED-3적일치성분별위34%화29%,재제169개안기산잔기처구유QACRG적오태활성위점,해활성위점시Caspase가족적전형결구.여과승Caspase가족취류분석중,BmICE여과승중구유단적N단결구역적DrICE、DCP-1급DECAY취위일류,근거기결구분석화취류분석,추측가잠BmIce기인가능삼여세포조망적집행작용.