CAJ | 학술논문

采用相关序列扩增多态性(Sequence-realted Amplified Polymorphism, SRAP)技术分析野生草鱼和家养草鱼,筛选与草鱼种质退化相关的分子遗传标记.共进行88对引物组合的检测, 产生标记数目共计905个.依据标记在群体中出现的频率和变化规律,共筛选出2 1个可能与种质相关的特异性标记,对这些特异性标记进行测序并将测序结果进行BLAST分析 .发现测得片段中有8个片段在GenBank中找到同源性较高的序列,而其他片段与数据库中序列的相似性较低.根据序列信息分别设计了3对引物.用这3对引物分别对草鱼三个群体进行 PCR扩增,分别产生了SCAR1(308 bp)、SCAR2(66 bp)、SCAR3(114 bp)3个扩增带.采用大样本对这3个标记进行验证,发现其中SCAR1在家养群体中呈现阳性,在野生群体中为阴性,可区分出这两种群体.以SCAR3为引物在174条家养群体中得到目的片段,在26个家养群体没有扩增出条带,分布频率为87%;在100个野生群体中有6个个体检测到该条带,分布频率为6%.以SCAR2为引物在野生群体中完全扩增出目的条带,淡水中心群体中有7条扩增到条带,前洲群体中没有扩增出条带,标记在家养种群中的分布频率为96.50%.因此SCAR1可作为草鱼家养群体的一个重要的分子遗传特征指标,为进一步进行分子标记辅助育种奠定了基础 [动物学报 54(3):475-481,2008].
채용상관서렬확증다태성(Sequence-realted Amplified Polymorphism, SRAP)기술분석야생초어화가양초어,사선여초어충질퇴화상관적분자유전표기.공진행88대인물조합적검측, 산생표기수목공계905개.의거표기재군체중출현적빈솔화변화규률,공사선출2 1개가능여충질상관적특이성표기,대저사특이성표기진행측서병장측서결과진행BLAST분석 .발현측득편단중유8개편단재GenBank중조도동원성교고적서렬,이기타편단여수거고중서렬적상사성교저.근거서렬신식분별설계료3대인물.용저3대인물분별대초어삼개군체진행 PCR확증,분별산생료SCAR1(308 bp)、SCAR2(66 bp)、SCAR3(114 bp)3개확증대.채용대양본대저3개표기진행험증,발현기중SCAR1재가양군체중정현양성,재야생군체중위음성,가구분출저량충군체.이SCAR3위인물재174조가양군체중득도목적편단,재26개가양군체몰유확증출조대,분포빈솔위87%;재100개야생군체중유6개개체검측도해조대,분포빈솔위6%.이SCAR2위인물재야생군체중완전확증출목적조대,담수중심군체중유7조확증도조대,전주군체중몰유확증출조대,표기재가양충군중적분포빈솔위96.50%.인차SCAR1가작위초어가양군체적일개중요적분자유전특정지표,위진일보진행분자표기보조육충전정료기출 [동물학보 54(3):475-481,2008].