计算机工程
計算機工程
계산궤공정
COMPUTER ENGINEERING
2012年
19期
266-268,273
,共4页
单核苷酸多态性%边缘效应%多基因交互%发病概率%全基因组关联分析%二分搜索
單覈苷痠多態性%邊緣效應%多基因交互%髮病概率%全基因組關聯分析%二分搜索
단핵감산다태성%변연효응%다기인교호%발병개솔%전기인조관련분석%이분수색
生成模拟数据对全基因组关联分析(GWAS)算法进行测试时,要求按单位点边缘效应大小计算出疾病模型的相关参数,而目前缺乏对应的公开算法.为此,基于二分搜索提出一个数值算法,根据单位点边缘效应和人群疾病发病率计算出3个典型的两位点疾病模型的控制参数.实验结果表明,该算法能快速精确地进行疾病模型参数求解,便于对GWAS算法进行大规模模拟测试.
生成模擬數據對全基因組關聯分析(GWAS)算法進行測試時,要求按單位點邊緣效應大小計算齣疾病模型的相關參數,而目前缺乏對應的公開算法.為此,基于二分搜索提齣一箇數值算法,根據單位點邊緣效應和人群疾病髮病率計算齣3箇典型的兩位點疾病模型的控製參數.實驗結果錶明,該算法能快速精確地進行疾病模型參數求解,便于對GWAS算法進行大規模模擬測試.
생성모의수거대전기인조관련분석(GWAS)산법진행측시시,요구안단위점변연효응대소계산출질병모형적상관삼수,이목전결핍대응적공개산법.위차,기우이분수색제출일개수치산법,근거단위점변연효응화인군질병발병솔계산출3개전형적량위점질병모형적공제삼수.실험결과표명,해산법능쾌속정학지진행질병모형삼수구해,편우대GWAS산법진행대규모모의측시.
