中华检验医学杂志
中華檢驗醫學雜誌
중화검험의학잡지
CHINESE JOURNAL OF LABORATORY MEDICINE
2006年
12期
1079-1083
,共5页
刘松梅%周新%涂建成%郑芳%杨艳%汤冬玲%蔡春林%熊燏
劉鬆梅%週新%塗建成%鄭芳%楊豔%湯鼕玲%蔡春林%熊燏
류송매%주신%도건성%정방%양염%탕동령%채춘림%웅율
寡核苷酸序列分析%糖尿病%DNA,线粒体%荧光强度%基因位点
寡覈苷痠序列分析%糖尿病%DNA,線粒體%熒光彊度%基因位點
과핵감산서렬분석%당뇨병%DNA,선립체%형광강도%기인위점
目的 建立一种快速、准确的检测糖尿病线粒体DNA常见易感基因位点的芯片技术.方法 将氨基修饰的16个常见易感基因位点(1888,3200,3206,3243,3290,3316,3394,3593,3426,12026,12258,14577,14693,14709,16189,16223)的野生型和突变型探针,通过Packard芯片点样仪点样于醛基修饰的基片上,室温保湿过夜固定.采用该基因芯片对52份已知和52份未知突变位点的2型糖尿病标本进行检测,每份样本平行测3次,Axon GenePix 4000B芯片扫描仪阅读芯片,GenePix Pro 4.0版芯片图像分析软件分析结果.结果 芯片样点分布均匀、清晰、规整度好、无漏点和连点;片内平行点之间的荧光强度变异系数为0.62%～9.64%,芯片间相同位点之间为1.00%～13.46%;背景信号低(突变型探针和野生型探针的背景荧光强度分别为43.25±2.10,44.56±2.63);减去背景信号的阳性探针荧光强度明显高于阴性探针(t=8.6,P=0.000),易于判断结果;初步设定筛选和诊断实验的突变型cut-off值;按此标准判断实验结果,筛选实验的假阳性率为11.11%,假阴性率为0.53%;诊断试验的假阳性率为2.22%,假阴性率为6.41%;除16189位点外,验证其他已知突变位点,并在未知突变样本中检出了A12026G突变和C16223T多态性,结果与测序结果一致.结论 该芯片可用于糖尿病线粒体DNA 15个常见易感基因位点的快速筛查和检验诊断.
目的 建立一種快速、準確的檢測糖尿病線粒體DNA常見易感基因位點的芯片技術.方法 將氨基脩飾的16箇常見易感基因位點(1888,3200,3206,3243,3290,3316,3394,3593,3426,12026,12258,14577,14693,14709,16189,16223)的野生型和突變型探針,通過Packard芯片點樣儀點樣于醛基脩飾的基片上,室溫保濕過夜固定.採用該基因芯片對52份已知和52份未知突變位點的2型糖尿病標本進行檢測,每份樣本平行測3次,Axon GenePix 4000B芯片掃描儀閱讀芯片,GenePix Pro 4.0版芯片圖像分析軟件分析結果.結果 芯片樣點分佈均勻、清晰、規整度好、無漏點和連點;片內平行點之間的熒光彊度變異繫數為0.62%～9.64%,芯片間相同位點之間為1.00%～13.46%;揹景信號低(突變型探針和野生型探針的揹景熒光彊度分彆為43.25±2.10,44.56±2.63);減去揹景信號的暘性探針熒光彊度明顯高于陰性探針(t=8.6,P=0.000),易于判斷結果;初步設定篩選和診斷實驗的突變型cut-off值;按此標準判斷實驗結果,篩選實驗的假暘性率為11.11%,假陰性率為0.53%;診斷試驗的假暘性率為2.22%,假陰性率為6.41%;除16189位點外,驗證其他已知突變位點,併在未知突變樣本中檢齣瞭A12026G突變和C16223T多態性,結果與測序結果一緻.結論 該芯片可用于糖尿病線粒體DNA 15箇常見易感基因位點的快速篩查和檢驗診斷.
목적 건립일충쾌속、준학적검측당뇨병선립체DNA상견역감기인위점적심편기술.방법 장안기수식적16개상견역감기인위점(1888,3200,3206,3243,3290,3316,3394,3593,3426,12026,12258,14577,14693,14709,16189,16223)적야생형화돌변형탐침,통과Packard심편점양의점양우철기수식적기편상,실온보습과야고정.채용해기인심편대52빈이지화52빈미지돌변위점적2형당뇨병표본진행검측,매빈양본평행측3차,Axon GenePix 4000B심편소묘의열독심편,GenePix Pro 4.0판심편도상분석연건분석결과.결과 심편양점분포균균、청석、규정도호、무루점화련점;편내평행점지간적형광강도변이계수위0.62%～9.64%,심편간상동위점지간위1.00%～13.46%;배경신호저(돌변형탐침화야생형탐침적배경형광강도분별위43.25±2.10,44.56±2.63);감거배경신호적양성탐침형광강도명현고우음성탐침(t=8.6,P=0.000),역우판단결과;초보설정사선화진단실험적돌변형cut-off치;안차표준판단실험결과,사선실험적가양성솔위11.11%,가음성솔위0.53%;진단시험적가양성솔위2.22%,가음성솔위6.41%;제16189위점외,험증기타이지돌변위점,병재미지돌변양본중검출료A12026G돌변화C16223T다태성,결과여측서결과일치.결론 해심편가용우당뇨병선립체DNA 15개상견역감기인위점적쾌속사사화검험진단.
