热带海洋学报
熱帶海洋學報
열대해양학보
JOURNAL OF TROPICAL OCEANOGRAPHY
2010年
3期
41-46
,共6页
孙慧敏%戴世鲲%王广华%谢练武%李翔
孫慧敏%戴世鯤%王廣華%謝練武%李翔
손혜민%대세곤%왕엄화%사련무%리상
南海%深海沉积物%细菌多样性
南海%深海沉積物%細菌多樣性
남해%심해침적물%세균다양성
从南海北部巴士海峡深海沉积物中提取到高质量的总DNA, 通过TA克隆构建了含有23个可操作分类单元(OTU)的16S rRNA基因文库, 选择各OTU中代表性克隆子进行测序与系统发育分析, 结果表明, 南海北部巴士海峡深海沉积物中细菌在系统进化树中至少分属于9个类群: 其中放线菌Actinobacteria, 变形细菌Proteobacteria, 和浮霉菌Planctomycetes为优势种;其他细菌如疣微菌Verrucomicrobia, 鞘脂杆菌Sphingobacteria, 硝化螺旋菌门(Nitrospira), 绿弯菌Chloroflexi, 厚壁菌Firmicute, 酸杆菌Acidobacteria等为非优势种群;另外有两个克隆子属于未知种群.在所获得的23个代表克隆子序列中,有11个序列与已知细菌的同源性≤95%, 占到了所有序列的48%, 这一结果说明在南海北部巴士海峡海区具有非常丰富的微生物多样性, 这一海区蕴含着大量未知的微生物资源, 因而值得进行进一步的研究探索.
從南海北部巴士海峽深海沉積物中提取到高質量的總DNA, 通過TA剋隆構建瞭含有23箇可操作分類單元(OTU)的16S rRNA基因文庫, 選擇各OTU中代錶性剋隆子進行測序與繫統髮育分析, 結果錶明, 南海北部巴士海峽深海沉積物中細菌在繫統進化樹中至少分屬于9箇類群: 其中放線菌Actinobacteria, 變形細菌Proteobacteria, 和浮黴菌Planctomycetes為優勢種;其他細菌如疣微菌Verrucomicrobia, 鞘脂桿菌Sphingobacteria, 硝化螺鏇菌門(Nitrospira), 綠彎菌Chloroflexi, 厚壁菌Firmicute, 痠桿菌Acidobacteria等為非優勢種群;另外有兩箇剋隆子屬于未知種群.在所穫得的23箇代錶剋隆子序列中,有11箇序列與已知細菌的同源性≤95%, 佔到瞭所有序列的48%, 這一結果說明在南海北部巴士海峽海區具有非常豐富的微生物多樣性, 這一海區蘊含著大量未知的微生物資源, 因而值得進行進一步的研究探索.
종남해북부파사해협심해침적물중제취도고질량적총DNA, 통과TA극륭구건료함유23개가조작분류단원(OTU)적16S rRNA기인문고, 선택각OTU중대표성극륭자진행측서여계통발육분석, 결과표명, 남해북부파사해협심해침적물중세균재계통진화수중지소분속우9개류군: 기중방선균Actinobacteria, 변형세균Proteobacteria, 화부매균Planctomycetes위우세충;기타세균여우미균Verrucomicrobia, 초지간균Sphingobacteria, 초화라선균문(Nitrospira), 록만균Chloroflexi, 후벽균Firmicute, 산간균Acidobacteria등위비우세충군;령외유량개극륭자속우미지충군.재소획득적23개대표극륭자서렬중,유11개서렬여이지세균적동원성≤95%, 점도료소유서렬적48%, 저일결과설명재남해북부파사해협해구구유비상봉부적미생물다양성, 저일해구온함착대량미지적미생물자원, 인이치득진행진일보적연구탐색.