中国水稻科学
中國水稻科學
중국수도과학
CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE
2011年
5期
467-474
,共8页
于颢%闫旭%郭卫东%辛德东
于顥%閆旭%郭衛東%辛德東
우호%염욱%곽위동%신덕동
microRNA%水稻%单核苷酸多态性
microRNA%水稻%單覈苷痠多態性
microRNA%수도%단핵감산다태성
microRNA(miRNA)是一类内源性非编码小RNA,长度约22个核苷酸.miRNA通过与靶基因rnRNA特定位点结合,调控植物生长、发育和胁迫耐受性.pre-miRNA的单核苷酸突变会影响miRNA的成熟过程和调控功能,因此,研究miRNA基因中的单核苷酸多态性(SNP)分布对研究miRNA功能分化和基因进化有重要意义.为探讨水稻miRNA基因单核苷酸多态性及其潜在生物学意义,基于现有水稻SNP数据,分析f水稻pre-miRNA区、侧冀区(位于pre-miRNA上下游,与pre-miRNA等长的区间)的SNP分布.与已经报道过的绝大多数生物不同,SNP在水稻pre-miRNA区的频率与侧翼区无显著差异.进一步研究SNP在pre-miRNA二级结构中的分布,发现种子区SNP频率跟茎区、环区也无显著差异.然而,SNP在水稻基因区分布跟其他生物相似,即基因区SNP频率显著低于基因侧翼区.这可能暗示pre-miRNA侧翼区功能对miRNA非常重要,也可能与SNP在不同miRNA基因之间的分布不均衡有关,一部分miRNA基因正经历纯化选择压力放松,积累较多突变而成为新的基因或失去功能.但是以上结果并不排除是由于当前水稻SNP数据可靠性不高而导致的偏差.
microRNA(miRNA)是一類內源性非編碼小RNA,長度約22箇覈苷痠.miRNA通過與靶基因rnRNA特定位點結閤,調控植物生長、髮育和脅迫耐受性.pre-miRNA的單覈苷痠突變會影響miRNA的成熟過程和調控功能,因此,研究miRNA基因中的單覈苷痠多態性(SNP)分佈對研究miRNA功能分化和基因進化有重要意義.為探討水稻miRNA基因單覈苷痠多態性及其潛在生物學意義,基于現有水稻SNP數據,分析f水稻pre-miRNA區、側冀區(位于pre-miRNA上下遊,與pre-miRNA等長的區間)的SNP分佈.與已經報道過的絕大多數生物不同,SNP在水稻pre-miRNA區的頻率與側翼區無顯著差異.進一步研究SNP在pre-miRNA二級結構中的分佈,髮現種子區SNP頻率跟莖區、環區也無顯著差異.然而,SNP在水稻基因區分佈跟其他生物相似,即基因區SNP頻率顯著低于基因側翼區.這可能暗示pre-miRNA側翼區功能對miRNA非常重要,也可能與SNP在不同miRNA基因之間的分佈不均衡有關,一部分miRNA基因正經歷純化選擇壓力放鬆,積纍較多突變而成為新的基因或失去功能.但是以上結果併不排除是由于噹前水稻SNP數據可靠性不高而導緻的偏差.
microRNA(miRNA)시일류내원성비편마소RNA,장도약22개핵감산.miRNA통과여파기인rnRNA특정위점결합,조공식물생장、발육화협박내수성.pre-miRNA적단핵감산돌변회영향miRNA적성숙과정화조공공능,인차,연구miRNA기인중적단핵감산다태성(SNP)분포대연구miRNA공능분화화기인진화유중요의의.위탐토수도miRNA기인단핵감산다태성급기잠재생물학의의,기우현유수도SNP수거,분석f수도pre-miRNA구、측기구(위우pre-miRNA상하유,여pre-miRNA등장적구간)적SNP분포.여이경보도과적절대다수생물불동,SNP재수도pre-miRNA구적빈솔여측익구무현저차이.진일보연구SNP재pre-miRNA이급결구중적분포,발현충자구SNP빈솔근경구、배구야무현저차이.연이,SNP재수도기인구분포근기타생물상사,즉기인구SNP빈솔현저저우기인측익구.저가능암시pre-miRNA측익구공능대miRNA비상중요,야가능여SNP재불동miRNA기인지간적분포불균형유관,일부분miRNA기인정경력순화선택압력방송,적루교다돌변이성위신적기인혹실거공능.단시이상결과병불배제시유우당전수도SNP수거가고성불고이도치적편차.
