四川农业大学学报
四川農業大學學報
사천농업대학학보
JOURNAL OF SICHUAN AGRICULTURAL UNIVERSITY
2006年
3期
325-330
,共6页
于小娜%汪铭书%程安春%李玲%段泽%钟传德%陈孝跃
于小娜%汪銘書%程安春%李玲%段澤%鐘傳德%陳孝躍
우소나%왕명서%정안춘%리령%단택%종전덕%진효약
鸭%大肠杆菌%Ⅰ型菌毛%pilA基因%PCR%序列分析
鴨%大腸桿菌%Ⅰ型菌毛%pilA基因%PCR%序列分析
압%대장간균%Ⅰ형균모%pilA기인%PCR%서렬분석
据GenBank中人源大肠杆菌pilA基因序列,由Oligo 6.0设计一对引物,以提取的鸭源致病性大肠杆菌基因组为模板,进行PCR扩增,获得了5株鸭源致病性大肠杆菌的pilA基因,序列测定和生物信息学分析表明:鸭源致病性大肠杆菌pilA基因核苷酸序列长度为549 bp,编码182aa,与人源、鸡源及猪源大肠杆菌pilA基因之间核苷酸同源性为87.3%～100.0%,氨基酸同源性为87.5%～100.0%.对不同宿主来源大肠杆菌pilA基因所编码蛋白的二级结构、亲水性、抗原性、抗原表位进行预测分析比较,结果显示Ⅰ型菌毛间具有一定的结构相似性,并存在一定的共同抗原位点;系统进化分析表明,各菌株之间的pilA基因遗传相关性与其宿主来源及血清型之间没有严格的相关性.
據GenBank中人源大腸桿菌pilA基因序列,由Oligo 6.0設計一對引物,以提取的鴨源緻病性大腸桿菌基因組為模闆,進行PCR擴增,穫得瞭5株鴨源緻病性大腸桿菌的pilA基因,序列測定和生物信息學分析錶明:鴨源緻病性大腸桿菌pilA基因覈苷痠序列長度為549 bp,編碼182aa,與人源、鷄源及豬源大腸桿菌pilA基因之間覈苷痠同源性為87.3%～100.0%,氨基痠同源性為87.5%～100.0%.對不同宿主來源大腸桿菌pilA基因所編碼蛋白的二級結構、親水性、抗原性、抗原錶位進行預測分析比較,結果顯示Ⅰ型菌毛間具有一定的結構相似性,併存在一定的共同抗原位點;繫統進化分析錶明,各菌株之間的pilA基因遺傳相關性與其宿主來源及血清型之間沒有嚴格的相關性.
거GenBank중인원대장간균pilA기인서렬,유Oligo 6.0설계일대인물,이제취적압원치병성대장간균기인조위모판,진행PCR확증,획득료5주압원치병성대장간균적pilA기인,서렬측정화생물신식학분석표명:압원치병성대장간균pilA기인핵감산서렬장도위549 bp,편마182aa,여인원、계원급저원대장간균pilA기인지간핵감산동원성위87.3%～100.0%,안기산동원성위87.5%～100.0%.대불동숙주래원대장간균pilA기인소편마단백적이급결구、친수성、항원성、항원표위진행예측분석비교,결과현시Ⅰ형균모간구유일정적결구상사성,병존재일정적공동항원위점;계통진화분석표명,각균주지간적pilA기인유전상관성여기숙주래원급혈청형지간몰유엄격적상관성.
