微生物学报
微生物學報
미생물학보
ACTA MICROBIOLOGICA SINICA
2008年
9期
1208-1213
,共6页
袁军%赖其良%郑天凌%邵宗泽
袁軍%賴其良%鄭天凌%邵宗澤
원군%뢰기량%정천릉%소종택
深海%新鞘氨醇杆菌%多环芳烃%降解%双加氧酶
深海%新鞘氨醇桿菌%多環芳烴%降解%雙加氧酶
심해%신초안순간균%다배방경%강해%쌍가양매
[目的]为了从深海环境中筛选新的多环芳烃降解菌,了解其降解基因及降解特性.[方法]以原油作为碳源从印度洋深海海水样品中富集筛选出降解能力较强的多环芳烃降解菌,并根据已报道的相关菌属的多环芳烃起始双加氧酶大亚基序列及侧翼序列设计兼并引物进行扩增.[结果]获得了1株能够高效降解原油、柴油及多种多环芳烃的菌株H25.经16S rDNA序列系统发育分析表明它属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium)(96%).并从该菌株中扩增获得2条相似度为91.0%双加氧酶基因片段.2条序列在NCBI上Blastn分析表明均与菌株N.aromaticivorans DSM12444T的降解质粒pNL1上的双加氧酶大亚基具有最高相似度,分别为99.6%和91.0%.根据pNL1上的双加氧酶序列设计引物获得了包含H25双加氧酶大亚基及上下游序列的2个基因片段H25 Ⅰ(2.9kb)和H25Ⅱ(4.5kb).另外,单碳降解实验表明H25对联苯、2-甲基萘、2,6-二甲基萘、菲、二苯并噻吩、二苯并呋喃等均有较好的降解能力.[结论]H25菌株是Novosphingobium属可能的新种.深海细菌在大洋环境多环芳烃污染的自然净化中起到一定作用,并在环境生物修复中有较大的应用前景.
[目的]為瞭從深海環境中篩選新的多環芳烴降解菌,瞭解其降解基因及降解特性.[方法]以原油作為碳源從印度洋深海海水樣品中富集篩選齣降解能力較彊的多環芳烴降解菌,併根據已報道的相關菌屬的多環芳烴起始雙加氧酶大亞基序列及側翼序列設計兼併引物進行擴增.[結果]穫得瞭1株能夠高效降解原油、柴油及多種多環芳烴的菌株H25.經16S rDNA序列繫統髮育分析錶明它屬于新鞘氨醇桿菌屬(Novosphingobium)(96%).併從該菌株中擴增穫得2條相似度為91.0%雙加氧酶基因片段.2條序列在NCBI上Blastn分析錶明均與菌株N.aromaticivorans DSM12444T的降解質粒pNL1上的雙加氧酶大亞基具有最高相似度,分彆為99.6%和91.0%.根據pNL1上的雙加氧酶序列設計引物穫得瞭包含H25雙加氧酶大亞基及上下遊序列的2箇基因片段H25 Ⅰ(2.9kb)和H25Ⅱ(4.5kb).另外,單碳降解實驗錶明H25對聯苯、2-甲基萘、2,6-二甲基萘、菲、二苯併噻吩、二苯併呋喃等均有較好的降解能力.[結論]H25菌株是Novosphingobium屬可能的新種.深海細菌在大洋環境多環芳烴汙染的自然淨化中起到一定作用,併在環境生物脩複中有較大的應用前景.
[목적]위료종심해배경중사선신적다배방경강해균,료해기강해기인급강해특성.[방법]이원유작위탄원종인도양심해해수양품중부집사선출강해능력교강적다배방경강해균,병근거이보도적상관균속적다배방경기시쌍가양매대아기서렬급측익서렬설계겸병인물진행확증.[결과]획득료1주능구고효강해원유、시유급다충다배방경적균주H25.경16S rDNA서렬계통발육분석표명타속우신초안순간균속(Novosphingobium)(96%).병종해균주중확증획득2조상사도위91.0%쌍가양매기인편단.2조서렬재NCBI상Blastn분석표명균여균주N.aromaticivorans DSM12444T적강해질립pNL1상적쌍가양매대아기구유최고상사도,분별위99.6%화91.0%.근거pNL1상적쌍가양매서렬설계인물획득료포함H25쌍가양매대아기급상하유서렬적2개기인편단H25 Ⅰ(2.9kb)화H25Ⅱ(4.5kb).령외,단탄강해실험표명H25대련분、2-갑기내、2,6-이갑기내、비、이분병새분、이분병부남등균유교호적강해능력.[결론]H25균주시Novosphingobium속가능적신충.심해세균재대양배경다배방경오염적자연정화중기도일정작용,병재배경생물수복중유교대적응용전경.