计算机工程与应用
計算機工程與應用
계산궤공정여응용
COMPUTER ENGINEERING AND APPLICATIONS
2009年
33期
193-196
,共4页
丁德武%陆克中%须文波%方康年
丁德武%陸剋中%鬚文波%方康年
정덕무%륙극중%수문파%방강년
代谢网络%代谢途径%基元模式%极端途径
代謝網絡%代謝途徑%基元模式%極耑途徑
대사망락%대사도경%기원모식%겁단도경
metabolic network%metabolic pathway%elementary modes%extreme pathways
由于缺乏详尽的热力学参数,基于网络拓扑的代谢途径分析是现阶段最重要的途径分析方法.首先简单地介绍了基于网络的途径分析方法发展简史,随后着重说明了基于凸分析的两种代谢途径分析方法:基元模式和极端途径及它们之间的异同,并详细阐述了这两种方法的具体应用.最后,使用极端途径分析了苏云金杆茵的PHB代谢.结果表明,除了传统的途径,还存在一些新颖的途径可用于PHB合成.
由于缺乏詳儘的熱力學參數,基于網絡拓撲的代謝途徑分析是現階段最重要的途徑分析方法.首先簡單地介紹瞭基于網絡的途徑分析方法髮展簡史,隨後著重說明瞭基于凸分析的兩種代謝途徑分析方法:基元模式和極耑途徑及它們之間的異同,併詳細闡述瞭這兩種方法的具體應用.最後,使用極耑途徑分析瞭囌雲金桿茵的PHB代謝.結果錶明,除瞭傳統的途徑,還存在一些新穎的途徑可用于PHB閤成.
유우결핍상진적열역학삼수,기우망락탁복적대사도경분석시현계단최중요적도경분석방법.수선간단지개소료기우망락적도경분석방법발전간사,수후착중설명료기우철분석적량충대사도경분석방법:기원모식화겁단도경급타문지간적이동,병상세천술료저량충방법적구체응용.최후,사용겁단도경분석료소운금간인적PHB대사.결과표명,제료전통적도경,환존재일사신영적도경가용우PHB합성.
Due to the absence of detailed kinetic parameters,one of the most important methods,network topology based metabolic pathway analysis has been developed.The paper firstly introduces the brief history of network based on pathway analysis.Then,two such network based methods are emphasized:Elementary modes and extreme pathways,with theft similarities,differences and ap-plications.At last,extreme pathways are employed to analyze PHB metabolism of B.thuringiensis.Exeept for "historical" biochemical pathways,the results also suggest that there are some novel pathways.