重庆医科大学学报
重慶醫科大學學報
중경의과대학학보
UNIVERSITATIS SCIENTIAE MEDICINAE CHONGQING
2008年
7期
769-772,787
,共5页
彭咏波%母昭德%马永平%夏永鹏%邱宗荫
彭詠波%母昭德%馬永平%夏永鵬%邱宗蔭
팽영파%모소덕%마영평%하영붕%구종음
MALDI-TOF-MS%PMF搜索%蛋白质%MS-Fit
MALDI-TOF-MS%PMF搜索%蛋白質%MS-Fit
MALDI-TOF-MS%PMF수색%단백질%MS-Fit
目的:为了优化肽质量指纹谱(Peptide mass fingerprinting,PMF)鉴定蛋白质时采用MS-Fit引擎搜索的分析参数.方法:将2-DE分离后的Carbonic anhydrase-2和BSA进行胶内充分酶解,肽段经过MALDI-TOF-MS分析得到PMF数据.选择Swissprot数据库,以Carbonic anhydrase2为模型优化搜索参数.结果:主要搜索参数的最佳设置为:半胱氨酸修饰为Carbamidomethylation,肽质量容错模型为百分数,在研究中0.1%容错数为最好.结论:本文通过标准蛋白对搜索主要参数的优化,建立了方便、可靠的MS-Fit搜索参数模式.
目的:為瞭優化肽質量指紋譜(Peptide mass fingerprinting,PMF)鑒定蛋白質時採用MS-Fit引擎搜索的分析參數.方法:將2-DE分離後的Carbonic anhydrase-2和BSA進行膠內充分酶解,肽段經過MALDI-TOF-MS分析得到PMF數據.選擇Swissprot數據庫,以Carbonic anhydrase2為模型優化搜索參數.結果:主要搜索參數的最佳設置為:半胱氨痠脩飾為Carbamidomethylation,肽質量容錯模型為百分數,在研究中0.1%容錯數為最好.結論:本文通過標準蛋白對搜索主要參數的優化,建立瞭方便、可靠的MS-Fit搜索參數模式.
목적:위료우화태질량지문보(Peptide mass fingerprinting,PMF)감정단백질시채용MS-Fit인경수색적분석삼수.방법:장2-DE분리후적Carbonic anhydrase-2화BSA진행효내충분매해,태단경과MALDI-TOF-MS분석득도PMF수거.선택Swissprot수거고,이Carbonic anhydrase2위모형우화수색삼수.결과:주요수색삼수적최가설치위:반광안산수식위Carbamidomethylation,태질량용착모형위백분수,재연구중0.1%용착수위최호.결론:본문통과표준단백대수색주요삼수적우화,건립료방편、가고적MS-Fit수색삼수모식.
