中国人兽共患病学报
中國人獸共患病學報
중국인수공환병학보
CHINESE JOURNAL OF ZOONOSES
2009年
8期
749-753
,共5页
禽流感病毒%H5N1%H3N2%NS基因%克隆%序列分析
禽流感病毒%H5N1%H3N2%NS基因%剋隆%序列分析
금류감병독%H5N1%H3N2%NS기인%극륭%서렬분석
目的 对3株分离自广西的禽流感病毒的NS基因进行序列分析,试图从分子水平分析和了解广西地区禽流感病毒NS基因的变异特点和进化规律.方法 根据GenBank上登录的已知禽流感病毒的NS基因全序列设计引物,对3株2004-2005年分离自广西的禽流感病毒株A/DK/GX/1566/04(H3N2)、A/Goose/GX/737/05(H5N1)、A/Goose/GX/2775/05(H5N1)的cDNA进行PCR扩增NS基因,并将其克隆到pMD-18T载体上,分别获得全长为855bp、834bp、837bp的NS基因全序列.结果 2株H5N1亚型禽流感病毒广西株间NS基因序列的同源性为95.3%,而2株H5N1亚型禽流感病毒株与H3N2亚型禽流感病毒株之间NS基因序列的同源性为94.0%~94.1%.H5N1亚型禽流感病毒广西株的NS基因在第238-253位核苷酸处均发生了15个核苷酸缺失,与我国广东、香港、云南、湖南、湖北及东南亚等不同地区的毒株比较,NS基因的核苷酸同源性为70.2%~97.6%.在NS基因系统进化树中,3株禽流感病毒广西株都属于A亚群,但处在不同的分支上,其中A/DK/GX/1566/04(H3N2)与广东、香港2001-2003年分离株处于同一分支;A/Goose/GX/737/05(H5N1)、A/Goose/GX/2775/05(H5N1)与我国华南地区以及韩国、越南、泰国等亚洲东南部国家的2003年以后的分离株有共同起源.结论 3株2004-2005年分离自广西的禽流感病毒株NS基因之间的同源性均高于94%,都属于A亚群.
目的 對3株分離自廣西的禽流感病毒的NS基因進行序列分析,試圖從分子水平分析和瞭解廣西地區禽流感病毒NS基因的變異特點和進化規律.方法 根據GenBank上登錄的已知禽流感病毒的NS基因全序列設計引物,對3株2004-2005年分離自廣西的禽流感病毒株A/DK/GX/1566/04(H3N2)、A/Goose/GX/737/05(H5N1)、A/Goose/GX/2775/05(H5N1)的cDNA進行PCR擴增NS基因,併將其剋隆到pMD-18T載體上,分彆穫得全長為855bp、834bp、837bp的NS基因全序列.結果 2株H5N1亞型禽流感病毒廣西株間NS基因序列的同源性為95.3%,而2株H5N1亞型禽流感病毒株與H3N2亞型禽流感病毒株之間NS基因序列的同源性為94.0%~94.1%.H5N1亞型禽流感病毒廣西株的NS基因在第238-253位覈苷痠處均髮生瞭15箇覈苷痠缺失,與我國廣東、香港、雲南、湖南、湖北及東南亞等不同地區的毒株比較,NS基因的覈苷痠同源性為70.2%~97.6%.在NS基因繫統進化樹中,3株禽流感病毒廣西株都屬于A亞群,但處在不同的分支上,其中A/DK/GX/1566/04(H3N2)與廣東、香港2001-2003年分離株處于同一分支;A/Goose/GX/737/05(H5N1)、A/Goose/GX/2775/05(H5N1)與我國華南地區以及韓國、越南、泰國等亞洲東南部國傢的2003年以後的分離株有共同起源.結論 3株2004-2005年分離自廣西的禽流感病毒株NS基因之間的同源性均高于94%,都屬于A亞群.
목적 대3주분리자엄서적금류감병독적NS기인진행서렬분석,시도종분자수평분석화료해엄서지구금류감병독NS기인적변이특점화진화규률.방법 근거GenBank상등록적이지금류감병독적NS기인전서렬설계인물,대3주2004-2005년분리자엄서적금류감병독주A/DK/GX/1566/04(H3N2)、A/Goose/GX/737/05(H5N1)、A/Goose/GX/2775/05(H5N1)적cDNA진행PCR확증NS기인,병장기극륭도pMD-18T재체상,분별획득전장위855bp、834bp、837bp적NS기인전서렬.결과 2주H5N1아형금류감병독엄서주간NS기인서렬적동원성위95.3%,이2주H5N1아형금류감병독주여H3N2아형금류감병독주지간NS기인서렬적동원성위94.0%~94.1%.H5N1아형금류감병독엄서주적NS기인재제238-253위핵감산처균발생료15개핵감산결실,여아국엄동、향항、운남、호남、호북급동남아등불동지구적독주비교,NS기인적핵감산동원성위70.2%~97.6%.재NS기인계통진화수중,3주금류감병독엄서주도속우A아군,단처재불동적분지상,기중A/DK/GX/1566/04(H3N2)여엄동、향항2001-2003년분리주처우동일분지;A/Goose/GX/737/05(H5N1)、A/Goose/GX/2775/05(H5N1)여아국화남지구이급한국、월남、태국등아주동남부국가적2003년이후적분리주유공동기원.결론 3주2004-2005년분리자엄서적금류감병독주NS기인지간적동원성균고우94%,도속우A아군.
