海洋通报
海洋通報
해양통보
MARINE SCIENCE BULLETIN
2007年
2期
100-104
,共5页
黄晖%杨泽民%张俊彬%李秀保%何建国%谢数涛%章群
黃暉%楊澤民%張俊彬%李秀保%何建國%謝數濤%章群
황휘%양택민%장준빈%리수보%하건국%사수도%장군
柳珊瑚%DNA提取%方法
柳珊瑚%DNA提取%方法
류산호%DNA제취%방법
通过 2 种样品前处理方式和 4 种不同的 DNA 提取方法相结合,提取橘色刺柳珊瑚(Echinogoria aurantiaca) 基因组DNA,并对其 18S rRNA 基因进行了克隆和测序.实验结果表明,对于 2 种样品前处理方式,采用纯酒精进行样品前处理比 PBS(磷酸缓冲液) 进行样品前处理效果要好.在 4 种不同的 DNA 提取方法中,以 CTAB(十六烷基三甲基溴化铵) 法提取基因组 DNA 效果最好,其余 3 种方法如 PVP(聚乙烯基吡咯烷酮) 法、高盐法和酚/氯仿法的提取效果较差.并且不同样品的钙质沉淀对 DNA 都有一定程度的吸附.最后,通过 PCR 扩增、克隆测序得到橘色刺柳珊瑚 18S rRNA 基因序列(AY962532).BLAST 软件进行序列比对表明橘色刺柳珊瑚与弱柳珊瑚(Leptogorgia chilensis) 的 18S rRNA 基因(AF052928) 同源性最高,为 98.79 %.
通過 2 種樣品前處理方式和 4 種不同的 DNA 提取方法相結閤,提取橘色刺柳珊瑚(Echinogoria aurantiaca) 基因組DNA,併對其 18S rRNA 基因進行瞭剋隆和測序.實驗結果錶明,對于 2 種樣品前處理方式,採用純酒精進行樣品前處理比 PBS(燐痠緩遲液) 進行樣品前處理效果要好.在 4 種不同的 DNA 提取方法中,以 CTAB(十六烷基三甲基溴化銨) 法提取基因組 DNA 效果最好,其餘 3 種方法如 PVP(聚乙烯基吡咯烷酮) 法、高鹽法和酚/氯倣法的提取效果較差.併且不同樣品的鈣質沉澱對 DNA 都有一定程度的吸附.最後,通過 PCR 擴增、剋隆測序得到橘色刺柳珊瑚 18S rRNA 基因序列(AY962532).BLAST 軟件進行序列比對錶明橘色刺柳珊瑚與弱柳珊瑚(Leptogorgia chilensis) 的 18S rRNA 基因(AF052928) 同源性最高,為 98.79 %.
통과 2 충양품전처리방식화 4 충불동적 DNA 제취방법상결합,제취귤색자류산호(Echinogoria aurantiaca) 기인조DNA,병대기 18S rRNA 기인진행료극륭화측서.실험결과표명,대우 2 충양품전처리방식,채용순주정진행양품전처리비 PBS(린산완충액) 진행양품전처리효과요호.재 4 충불동적 DNA 제취방법중,이 CTAB(십륙완기삼갑기추화안) 법제취기인조 DNA 효과최호,기여 3 충방법여 PVP(취을희기필각완동) 법、고염법화분/록방법적제취효과교차.병차불동양품적개질침정대 DNA 도유일정정도적흡부.최후,통과 PCR 확증、극륭측서득도귤색자류산호 18S rRNA 기인서렬(AY962532).BLAST 연건진행서렬비대표명귤색자류산호여약류산호(Leptogorgia chilensis) 적 18S rRNA 기인(AF052928) 동원성최고,위 98.79 %.
