生物技术通报
生物技術通報
생물기술통보
BIOTECHNOLOGY BULLETIN
2012年
9期
80-86
,共7页
罗秀刚%马小军%张小丽%岳燕%李富强%姜力飞
囉秀剛%馬小軍%張小麗%嶽燕%李富彊%薑力飛
라수강%마소군%장소려%악연%리부강%강력비
DRB3基因%多态性%PCR-SSCP%河西绒山羊
DRB3基因%多態性%PCR-SSCP%河西絨山羊
DRB3기인%다태성%PCR-SSCP%하서융산양
研究采用PCR-SSCP方法检测1046只河西绒山羊DRB3基因第2外显子的多态性,并克隆、测序群体内变异产生的各等位基因,分析各等位基因间的遗传关系和进化意义.结果表明,河西绒山羊DRB3基因第2外显子表现了18个等位基因(LG001 -LG018)控制的31个基因型,LG005为优势等位基因,LG005*005为优势基因型,18个单倍型序列分析发现44个核苷酸多态位点、29个氨基酸多态位点;与GenBank下载序列比对分析结果表明,16个DRB3的等位基因是本研究首次发现;DRB3基因遗传多态指数中,观察杂合度为0.269 6,多态信息含量为0.869 9,有效等位基因数为1.369 1;经x2适合性检验,该群体偏离了Hardy-Weinberg平衡状态(P＜0.05);18个DRB3基因外显子2的单倍型序列NJ系统发育树呈2支分化趋势.研究认为河西绒山羊DRB3基因第2外显子具有丰富的遗传多态性;河西绒山羊DRB3基因最初由2个等位基因突变分化成两大类等位基因.
研究採用PCR-SSCP方法檢測1046隻河西絨山羊DRB3基因第2外顯子的多態性,併剋隆、測序群體內變異產生的各等位基因,分析各等位基因間的遺傳關繫和進化意義.結果錶明,河西絨山羊DRB3基因第2外顯子錶現瞭18箇等位基因(LG001 -LG018)控製的31箇基因型,LG005為優勢等位基因,LG005*005為優勢基因型,18箇單倍型序列分析髮現44箇覈苷痠多態位點、29箇氨基痠多態位點;與GenBank下載序列比對分析結果錶明,16箇DRB3的等位基因是本研究首次髮現;DRB3基因遺傳多態指數中,觀察雜閤度為0.269 6,多態信息含量為0.869 9,有效等位基因數為1.369 1;經x2適閤性檢驗,該群體偏離瞭Hardy-Weinberg平衡狀態(P＜0.05);18箇DRB3基因外顯子2的單倍型序列NJ繫統髮育樹呈2支分化趨勢.研究認為河西絨山羊DRB3基因第2外顯子具有豐富的遺傳多態性;河西絨山羊DRB3基因最初由2箇等位基因突變分化成兩大類等位基因.
연구채용PCR-SSCP방법검측1046지하서융산양DRB3기인제2외현자적다태성,병극륭、측서군체내변이산생적각등위기인,분석각등위기인간적유전관계화진화의의.결과표명,하서융산양DRB3기인제2외현자표현료18개등위기인(LG001 -LG018)공제적31개기인형,LG005위우세등위기인,LG005*005위우세기인형,18개단배형서렬분석발현44개핵감산다태위점、29개안기산다태위점;여GenBank하재서렬비대분석결과표명,16개DRB3적등위기인시본연구수차발현;DRB3기인유전다태지수중,관찰잡합도위0.269 6,다태신식함량위0.869 9,유효등위기인수위1.369 1;경x2괄합성검험,해군체편리료Hardy-Weinberg평형상태(P＜0.05);18개DRB3기인외현자2적단배형서렬NJ계통발육수정2지분화추세.연구인위하서융산양DRB3기인제2외현자구유봉부적유전다태성;하서융산양DRB3기인최초유2개등위기인돌변분화성량대류등위기인.
